Понятие "секвинирована" растяжимо. То, что идет в HGP, имеет 200-300-кратное покрытие и очень надежную сборку. Тут, насколько я понял, речь идет об общей структуре хромосомы, по которой уже видно, что к чему. Скажем, 1% ошибочно-прочитанных оснований это супер-много и такое в HGP не выложат, но если речь идет о 30-50% различиях, то такая точность вполне достаточна. Плюс обнаружились не только изменения в последовательности, но и колоссальная перестройка всей структуры.