Получил ссылку на статью: http://www.sidasante.com/themes/tests/pcr/false_positive_viral_loads.htm где поднимается вопрос о значительном количестве ложноположительных ПЦР. По-моему это противоречит Вашему мнению о редкости подобных случаев. Не могли бы Вы её прокомментировать?
Так же этой статьёй навеяло вопрос. Каким образом проверяют специфичность ПЦР тестирования? Если проверка происходит при помощи тестов на антитела, то не следует ли из этого, что в различных лабораториях и странах результаты тестов будут различаться (в связи с тем, что в разных странах используются различные наборы антител на основе которых ставят диагноз)?
shvarz Вообще теория с человеческими последовательностями принимаемыми за ВИЧ последовательности совершенно смешна. Я много видел дениалистов, но эта теория - одна из самых дурацких. Она совершенно не согласуется с целой массой хорошо установленных фактов: 1. Как я уже сказал, статус ПЦР реакции меняется в людях со временем. Человеческая ДНК не меняется со временем. tgg Причем тут геномная ДНК? Процедура ПЦР не проводится напрямую с ДНК. Сначала выделяют РНК, проводят обратную транскрипцию и уже потом исследуют продукт этой транскрипции. Может, будете утверждать, что у человека и РНК не меняется? ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ shvarz 2. ПЦР реакции положительны только для определенного набора клеток - лимфоцитов и макрофагов, но отрицательны для, например, мышечных клеток. У человека ДНК во всех клетках одинакова (за исключением хорошо характеризованных перестроек в B и Т клеточных рецепторах). tgg Отстаете от жизни – в скелетных мышцах РНК ВИЧ давно нашли! ))))))))))))) In situ detection of polymerase chain reaction-amplified HIV-1 nucleic acids in skeletal muscle in patients with myopathy. Кроме того, ПЦР успешно выявляет «РНК ВИЧ» в тканях головного мозга, сперматозоидах, слизистой шейки матки, пневмоцитах и т.д. К слову, на практике ПЦР проводят в бесклеточной среде – плазме или сыворотке. Откуда там взялась та или иная РНК, можно только гадать. ------------------ shvarz 3. Амплифицируемая последовательность из одного человека чрезвычайно разнообразна и меняется со временем. Человеческая ДНК постоянна. Вирус же мутуирует. tgg Если вирус мутирует, почему на протяжении долгого времени у всех клиентов подряд применяют одни и те же праймеры?)))))))))) ------------- shvarz 4. Инверсивный ПЦР позволяет нам установить где именно находятся амплифицируемые последовательности в человеческом геноме и для ВИЧ последовательности он показывает, что это место а) разное у разных людей и б) разное в разных клетках одного и того же человека. Никакие известные человеческие последовательности так себя не ведут и нам не известны никакие механизмы, которые в принципе могли бы объяснить такое поведение без привлечения инфекционной природы этой последовательности. tgg Человеческий геном-то еще не полностью расшифрован, что уж говорить об изученности роли отдельных последовательностей. Плюс Вы, надеюсь, слыхали про экспрессию генов? Где они экспрессируются, там и появляется РНК, которую Вы принимаете за вирусную. -------------- shvarz 5. Эпидемиологически, когда мы можем установить кто заразился от кого (в теории дениалистов - никто не заразился, но люди занимались друг с другом сексом или делели иглу), то амплифицируемые последовательности из этих людей очень схожи и отличаются от последовательностей из других людей. Вирусная теория это может объяснить, а дениалистская - нет (откуда такое странное совпадение?). tgg Доказательства где?!?!?! --------------- shvarz 6. Передача вируса от матери к ребенку. Принятие антиретровирусных препаратов беременной матерью влияет на вероятность положительного ПЦР анализа для ребенка. Опять же, вирусная теория это объясняет, а теория наследования генов - никак. tgg Это вероятность сама по себе (без вмешательства) колеблется в настолько широких пределах в зависимости от предпочтений и целей авторов)))))), что доказать ее уменьшение строгой статистикой невозможно.
no subject
http://www.sidasante.com/themes/tests/pcr/false_positive_viral_loads.htm
где поднимается вопрос о значительном количестве ложноположительных ПЦР. По-моему это противоречит Вашему мнению о редкости подобных случаев. Не могли бы Вы её прокомментировать?
Так же этой статьёй навеяло вопрос. Каким образом проверяют специфичность ПЦР тестирования? Если проверка происходит при помощи тестов на антитела, то не следует ли из этого, что в различных лабораториях и странах результаты тестов будут различаться (в связи с тем, что в разных странах используются различные наборы антител на основе которых ставят диагноз)?
shvarz
Вообще теория с человеческими последовательностями принимаемыми за ВИЧ последовательности совершенно смешна.
Я много видел дениалистов, но эта теория - одна из самых дурацких. Она совершенно не согласуется с целой массой хорошо установленных фактов:
1. Как я уже сказал, статус ПЦР реакции меняется в людях со временем. Человеческая ДНК не меняется со временем.
tgg
Причем тут геномная ДНК? Процедура ПЦР не проводится напрямую с ДНК. Сначала выделяют РНК, проводят обратную транскрипцию
и уже потом исследуют продукт этой транскрипции. Может, будете утверждать, что у человека и РНК не меняется?
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
shvarz
2. ПЦР реакции положительны только для определенного набора клеток - лимфоцитов и макрофагов, но отрицательны для, например, мышечных клеток.
У человека ДНК во всех клетках одинакова (за исключением хорошо характеризованных перестроек в B и Т клеточных рецепторах).
tgg
Отстаете от жизни – в скелетных мышцах РНК ВИЧ давно нашли! )))))))))))))
In situ detection of polymerase chain reaction-amplified HIV-1 nucleic acids in skeletal muscle in patients with myopathy.
Кроме того, ПЦР успешно выявляет «РНК ВИЧ» в тканях головного мозга, сперматозоидах, слизистой шейки матки, пневмоцитах и т.д.
К слову, на практике ПЦР проводят в бесклеточной среде – плазме или сыворотке. Откуда там взялась та или иная РНК, можно только гадать.
------------------
shvarz
3. Амплифицируемая последовательность из одного человека чрезвычайно разнообразна и меняется со временем. Человеческая ДНК постоянна.
Вирус же мутуирует.
tgg
Если вирус мутирует, почему на протяжении долгого времени у всех клиентов подряд применяют одни и те же праймеры?))))))))))
-------------
shvarz
4. Инверсивный ПЦР позволяет нам установить где именно находятся амплифицируемые последовательности в человеческом геноме
и для ВИЧ последовательности он показывает, что это место а) разное у разных людей и б) разное в разных клетках одного и того же человека.
Никакие известные человеческие последовательности так себя не ведут и нам не известны никакие механизмы,
которые в принципе могли бы объяснить такое поведение без привлечения инфекционной природы этой последовательности.
tgg
Человеческий геном-то еще не полностью расшифрован, что уж говорить об изученности роли отдельных последовательностей.
Плюс Вы, надеюсь, слыхали про экспрессию генов? Где они экспрессируются, там и появляется РНК, которую Вы принимаете за вирусную.
--------------
shvarz
5. Эпидемиологически, когда мы можем установить кто заразился от кого (в теории дениалистов - никто не заразился,
но люди занимались друг с другом сексом или делели иглу), то амплифицируемые последовательности из этих людей очень схожи
и отличаются от последовательностей из других людей. Вирусная теория это может объяснить, а дениалистская - нет (откуда такое странное совпадение?).
tgg
Доказательства где?!?!?!
---------------
shvarz
6. Передача вируса от матери к ребенку. Принятие антиретровирусных препаратов беременной матерью влияет на вероятность положительного ПЦР анализа
для ребенка. Опять же, вирусная теория это объясняет, а теория наследования генов - никак.
tgg
Это вероятность сама по себе (без вмешательства) колеблется в настолько широких пределах в зависимости от предпочтений и целей авторов)))))),
что доказать ее уменьшение строгой статистикой невозможно.