>Специфичность разрезов определяется, понятное дело, протеазой. У каждого вируса она своя, так что теоретически вряд ли можно предсказать точное место разреза в любом произвольном вирусе.
Для меня самй интересный вопрос именно здесь: неужели ничего не известно об общих сигнальных мотивов распознаваемых протеазами как участки разрезки?! Они настолько специфичные все?
>Типа - "разрезы маловероятны внутри альфа-спирали".
Да, идея хорошая, учитывая очень неплохую предсказываемость вторичной структуры.
>Экспериментально же установить место разреза в неком конкретном вирусе довольно просто - разогнать вирусный преп на геле, вырезать кусочки с каждым из белков, очистить, отсеквинировать первые 5-6 аминокислот.
Спасибо, просветили. Но метод, все-таки, предполагает существованиехоть какой приблизительной информации о колличестве белков и их примерных расположениях, так? (коли вырежаются куски с каждым из белков)
no subject
>Специфичность разрезов определяется, понятное дело, протеазой. У каждого вируса она своя, так что теоретически вряд ли можно предсказать точное место разреза в любом произвольном вирусе.
Для меня самй интересный вопрос именно здесь: неужели ничего не известно об общих сигнальных мотивов распознаваемых протеазами как участки разрезки?! Они настолько специфичные все?
>Типа - "разрезы маловероятны внутри альфа-спирали".
Да, идея хорошая, учитывая очень неплохую предсказываемость вторичной структуры.
>Экспериментально же установить место разреза в неком конкретном вирусе довольно просто - разогнать вирусный преп на геле, вырезать кусочки с каждым из белков, очистить, отсеквинировать первые 5-6 аминокислот.
Спасибо, просветили. Но метод, все-таки, предполагает существованиехоть какой приблизительной информации о колличестве белков и их примерных расположениях, так? (коли вырежаются куски с каждым из белков)