То, о чем вы пишете - один из возможных механизмов, но он не достаточен и не необходим для описанного "сцепления". В данном случае речь идет именно о физическом сцеплении участков на одной цепи ДНК и поэтому главной причиной таки является именно то, что "ДНК наследуется большими кусками".