Доступ к данным

[shvarz]

Интересный парадокс (ну, если не парадокс, то противоречие) обнаруживается, когда говоришь с учеными о предоставлении открытого доступа к данным. С одной стороны, они не доверяют данным из других лабораторий и не особенно жаждут в них копаться. С другой стороны, они считают свои собственные данные необычайно ценными и уверены, что стоит их выложить, как все тут же кинутся в них копаться.

P.S: У меня во френдах есть практикующие ученые: Вы согласились бы выкладывать свои сырые необработанные данные в открытый доступ? Не сразу, конечно, а допустим через год после их получения. Предполагается, что для этого есть специальные программы и базы данных и у вас не уйдет на это много времени и сил. Стали бы вы анализировать данные из других лабораторий?

Comments

[sliger.livejournal.com]

Основной материал я бы выложил опосля публикации. Часть данных, которые я никак пока не могу "переварить" я бы уже выложил сейчас с призывом "Разобрать, к чертям, и побыстрее", да начальница аки собака на сене - не дает даже до соседней лабы сходить к спецам на предмет мозгового штурма. Постдок человек подневольный :(.

В прочем, характер данных для узкого круга - записи спонтанных осциляций внутриклеточного кальция в клетках органной культуры эмбриональной почки. "Кальциеведы", как правило, или в нейрологии сидят и им почка, как собаке пятая нога, или же занимаются механизмами на молекулярном уровне - органный уровень для них не интересен.

[shvarz.livejournal.com]

Ну да, делиться через централизованные базы данных имеет смысл лишь для тех данных, которые могут быть интересны большому количеству людей. Если в вашей области 5 человек, то вы и так сможете договориться почти обо всем :)

[sliger.livejournal.com]

У меня все еще запущеннее - я пока один. Почечники разводят руками - дескать интересно, но не наше им генетические модели подавай. Мозговеды тоже разводят руками - почка не мозги, синапсов не найдешь. Остается только биофизиков привлекать к анализу данных, но их в лабе мало, на мой проект начальство не "выделяет" людской ресурс, а в коллаборацию тоже не хотят, жадничают. Вот тихо все и ковыряю в одну лопату. Сам себе и швец и жнец. Не правильно это, но мне, как постдоку, пока трудно тягаться с двумя профессорами.

[shvarz.livejournal.com]

Ну это да, совсем иной случай. Тут действительно большого смысле выкладывать данные нет. Речь шла о тех областях, где аккумуляция данных, полученных более-менее стандартизированными методами в разных лабораториях может принести пользу.

[sliger.livejournal.com]

Такого рода данные, например, транскриптомы с разных эмбриональных закладок и стадий развития, почечники выкладывают уже много лет в своей спец базе. Если и у нас "выгорит" проект, то тоже выложим. На публикацию это никак не влияет.

[shvarz.livejournal.com]

Ага, существуют вполне работающие базы данных и открытые области науки. Речь идет о тех, кто рутинно данные не выкладывает и которых пытаешься убедить в преимуществах такого подхода.

[shao-s.livejournal.com]

Я, кстати, как раз из мозговедческой лаборатории, где много с кальцием работают. В основном, Fluorescent Imaging, но и не только: делаются у нас и модели, и много всякого-прочего. Неспецифически синаптического, имею в виду. Может, если интересно - напишете подробней, какая у вас тема? Возможно, кто-то у нас придумает нечто, что сможет понравиться вашему начальству. Т.е. получится "прорыв блокады" :о)

Если есть желание - пишите на preference{ё}bigmir.net

[sliger.livejournal.com]

Ок, спасибо за предложение. Как просвет появится в работе- напишу в общих чертах в чем закавыка.