shvarz: (Default)
shvarz ([personal profile] shvarz) wrote2012-01-19 10:30 pm

Успехи микроскопии

Белок оболочки ВИЧ, как известно, не кристаллизуется. Вот уже двадцать с лишним лет народ бьется, а все без толку. См. пост на эту тему.

Сегодня был на семинаре, где показали практически полную структуру, но полученную не кристаллизацией, а single particle cryo electron microscopy. Принцип такой - делаем миллион (вернее 4 миллиона) электронных фотографий нужного белка, потом три года на компьютере их сортируем и суммируем (для этого, конечно, нужен упорный и талантливый китаец, который не спит, не ест, и отпуск не берет). В результате получаем вполне нативную структуру белка с разрешением в <5A, т.е. близко к кристаллографическому.

Овчинка выделки стоила - структура оказалась довольно неожиданной и при этом многое объясняет о свойствах этого белка. Надеюсь скоро опубликуют (хотя ходят слухи, что Science статью завернула).

[identity profile] overscience-mes.livejournal.com 2012-01-20 03:41 am (UTC)(link)
Да, крио эм прикольный метод, но когда известны хотя бы части структуры, уже не такой печальный, хотя и не стандартный все еще.

[identity profile] tea-with-milk.livejournal.com 2012-01-20 04:10 am (UTC)(link)
Сейчас крио томография очень hot, хотя разрешение еще далеко. Single particle одно из самых "древних" направлений, и очень популярно среди структурных вирусников, но уже не так интересно по ряду причин, если конечно не подбираются к кристаллографическому разрешению.