Последовательность известна, но какие именно мутации вызвали аттенуацию - нет. Да, кстати, и последовательность тоже дело мутное. По-моему аттенуированные вакцины никто из плазмид не получает, там swarm обычно. И даже когда исходный источник один, то у разных производителей разные штаммы получаются из-за дрейфа и эффекта основателя. Про BCG (это не вирус, конечно, но ради примера) точно известно, что он разный в разных странах.