Не могу ответить,потому что не понимаю формулировки "в какой-то момент два вируса попали в одну и ту же курицу". Пусть Егор объяснит.

Если имеется в виду, что курица была непривитая и заразилась от соседок сразу двумя вирусами, против ни одного из которых у нее не было иммунитета - то ничего не мешает повторить это на непривитых детях.
Если курицу прививали 2 раза, но разными вакцинами - то повторить это на Вашем ребенке можете помешать Вы. Имеете полное право при любой прививке потребовать у врача сертификат на вакцину, записать производителя и при ревакцинации потребовать именно эту вакцину, и никакую другую.

Но вообще я не совсем понимаю, как это могло произойти даже с курицей.