Книгу не читал (Контакт), но кино смотрел. Поэтому не знаю, насколько содержание фильма соответствует книге, но мне кажется, что параллель с религией является центральной темой и вокруг этого все и закручено.
Когда героиня возвращается безо всяких доказательств контакта и просит поверить ей на слово, исключительно потому что она - ученый и просто "выдумать" ничего не может по определению (а к ее рассказам все, естественно, относятся с сомнением), разве это не то, что вменяют верующим, когда те рассказывают о своем религиозном опыте?