shvarz: (Default)
shvarz ([personal profile] shvarz) wrote2010-12-01 10:34 pm

Phylo

Забавная игрушка
Загружает настоящие ДНК последовательности разных видов животных, представляет нуклеотиды в виде цветных квадратиков и предлагает их выровнять вручную. Задача - сделать это лучше компьютера за отведенное время.



Советую пройти Tutorial и прочитать FAQ, чтобы понять как именно начисляются баллы. Вкратце: По выровняным последовательностям вычисляется общий предок, последовательности сравниваются с ним (не между собой!). За совпадение дают +1 балл, за несовпадение -1 балл, за дырку длиной в один нуклеотид -5 баллов, за каждую следующую дырку рядом -1 балл. Дырки считаются как в центре, так и по краям (я это не сразу понял, но постфактум понятно, почему так сделано). В общем, несколько сложно, но когда разберешься становится довольно интересно. Я частенько выравниваю лучше компьютера.

Утверждается, что результаты всех этих выравниваний потом будут собраны и загружены обратно в базу данных, так что вроде как эти игры принесут некую реальную пользу науке, но это все фигня на мой взгляд. Но поиграть все равно интересно, затягивает.

[identity profile] megazver.livejournal.com 2010-12-02 03:12 pm (UTC)(link)
Насчет этой игры не знаю, но, скажем, FoldIt говорят действительно приносит какую-то пользу.

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2010-12-02 03:17 pm (UTC)(link)
Это очень трудно оценить. Но вообще возможно - там задачи куда более сложные для рассчетов и возможно мозг с ними действительно лучше справляется. Проблема с этими игрушками в том, что в результате качество конечного продукта все равно оценивается компьютером согласно неким правилам. Вот на скриншоте выше я выровнял самую верхнюю и самую нижнюю последовательности (для меня очевидно, что это должно быть именно так), однако если нижнюю последовательность сдвинуть на одну клетку вправо, то балл получается выше - недостаток алгоритма. Если в итоге все равно меряем алгоритмом, то какой смысл в мозге? :)

Проблема с этими игрушками в том

[identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com 2010-12-02 07:49 pm (UTC)(link)
А кто дал денег на разработку этой игрушки?

Re: Проблема с этими игрушками в том

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2010-12-02 07:51 pm (UTC)(link)
Авторы из МкГилла, так что видимо канадцы.

Re: Проблема с этими игрушками в том

[identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com 2010-12-02 08:52 pm (UTC)(link)
жалко канадцев. могли бы с пользой потратить

Re: Проблема с этими игрушками в том

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2010-12-02 09:08 pm (UTC)(link)
От PR тоже польза есть.