shvarz: (Default)
shvarz ([personal profile] shvarz) wrote2012-01-19 10:30 pm

Успехи микроскопии

Белок оболочки ВИЧ, как известно, не кристаллизуется. Вот уже двадцать с лишним лет народ бьется, а все без толку. См. пост на эту тему.

Сегодня был на семинаре, где показали практически полную структуру, но полученную не кристаллизацией, а single particle cryo electron microscopy. Принцип такой - делаем миллион (вернее 4 миллиона) электронных фотографий нужного белка, потом три года на компьютере их сортируем и суммируем (для этого, конечно, нужен упорный и талантливый китаец, который не спит, не ест, и отпуск не берет). В результате получаем вполне нативную структуру белка с разрешением в <5A, т.е. близко к кристаллографическому.

Овчинка выделки стоила - структура оказалась довольно неожиданной и при этом многое объясняет о свойствах этого белка. Надеюсь скоро опубликуют (хотя ходят слухи, что Science статью завернула).

[identity profile] apredeus.livejournal.com 2012-01-20 05:35 am (UTC)(link)
18-ангстремная структура - это оксиморон :))) это скорее форма, чем структура.

оно же по мнк подбирается, туда влезет что угодно.

[identity profile] kelavrik-0.livejournal.com 2012-01-20 11:35 am (UTC)(link)
Зато эти структуры ровненькие, без разрывов. Все углы стандартные, любо дорого смотреть :)

[identity profile] riftsh.livejournal.com 2012-01-22 03:29 am (UTC)(link)
Вполне структура, только не на атомном уровне. Но и 5 А - не атомное разрешение, половина всех белков в PDB могут быть наложены друг на друга с RMSD 5 А.

[identity profile] apredeus.livejournal.com 2012-01-22 05:38 pm (UTC)(link)
ну я что-то такое и имел в виду, да :)