shvarz: (Default)
shvarz ([personal profile] shvarz) wrote2012-01-19 10:30 pm

Успехи микроскопии

Белок оболочки ВИЧ, как известно, не кристаллизуется. Вот уже двадцать с лишним лет народ бьется, а все без толку. См. пост на эту тему.

Сегодня был на семинаре, где показали практически полную структуру, но полученную не кристаллизацией, а single particle cryo electron microscopy. Принцип такой - делаем миллион (вернее 4 миллиона) электронных фотографий нужного белка, потом три года на компьютере их сортируем и суммируем (для этого, конечно, нужен упорный и талантливый китаец, который не спит, не ест, и отпуск не берет). В результате получаем вполне нативную структуру белка с разрешением в <5A, т.е. близко к кристаллографическому.

Овчинка выделки стоила - структура оказалась довольно неожиданной и при этом многое объясняет о свойствах этого белка. Надеюсь скоро опубликуют (хотя ходят слухи, что Science статью завернула).

[identity profile] zhevago.livejournal.com 2012-01-20 06:53 pm (UTC)(link)
Ну еще бы не завернули. Такая же (вроде бы) работа давно уже висит в JVi

Three-dimensional structures of soluble CD4-bound states of trimeric simian immunodeficiency virus envelope glycoproteins determined by using cryo-electron tomography.
White TA, Bartesaghi A, Borgnia MJ, de la Cruz MJ, Nandwani R, Hoxie JA, Bess JW, Lifson JD, Milne JL, Subramaniam S.
J Virol. 2011 Dec;85(23):12114-23. Epub 2011 Sep 21.

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-01-20 07:00 pm (UTC)(link)
У Subramaniam разрешение ниже изрядно. Но вообще да, поскольку там основные моменты уже видны, для Science просто увеличение разрешения не тянет.