Успехи микроскопии

[shvarz]

Белок оболочки ВИЧ, как известно, не кристаллизуется. Вот уже двадцать с лишним лет народ бьется, а все без толку. См. пост на эту тему.

Сегодня был на семинаре, где показали практически полную структуру, но полученную не кристаллизацией, а single particle cryo electron microscopy. Принцип такой - делаем миллион (вернее 4 миллиона) электронных фотографий нужного белка, потом три года на компьютере их сортируем и суммируем (для этого, конечно, нужен упорный и талантливый китаец, который не спит, не ест, и отпуск не берет). В результате получаем вполне нативную структуру белка с разрешением в <5A, т.е. близко к кристаллографическому.

Овчинка выделки стоила - структура оказалась довольно неожиданной и при этом многое объясняет о свойствах этого белка. Надеюсь скоро опубликуют (хотя ходят слухи, что Science статью завернула).

Comments

[imbg.livejournal.com]

Кстати структуру RegIII (http://imbg.livejournal.com/194743.html) тоже с помощью микроскопа сделали. Оно акое в виде катушки у них получилось. Тоже китаец свой пост-док провел у микроскопа, сидя с фотоаппаратом, что-то около сотен тысяч фоток.

[shvarz.livejournal.com]

Для белков, которые очень мобильные, наверно лучше способа и не придумаешь. Вроде как новые алгоритмы могут таже сортировать фотки по конформациям (если есть несколько более-менее четко-выраженных).

[(Anonymous)]

Я не эксперт, но вот еще интересная новость в тему:
http://newscenter.lbl.gov/feature-stories/2012/01/24/3d-protein/
Получают 3D изображение отдельных белков при помощи электронного микроскопа с довольно хорошим разрешением.