shvarz: (Default)
shvarz ([personal profile] shvarz) wrote2011-03-29 02:39 pm

Секвинирование

В февральском номере Nature две интересные статьи (обе в открытом доступе):
Eric Lander's "Initial impact of the sequencing of human genome"
Elaine Mardis' "A decade's perspective on DNA sequencing technology"

Картинка из второй статьи: Выход (в тысячах нуклеотидов) одного прогона среднего секвенатора:

(шкала логарифмическая).
Я для сравнения наложил темпы роста размера харддрайва в персональном компьютере за эти же годы (синяя линия).

[identity profile] true-stranger.livejournal.com 2011-03-29 08:48 pm (UTC)(link)
Даже если так, то на пару порядков завышено.

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2011-03-29 09:03 pm (UTC)(link)
А в левой части графика? Там получается 10^5 нуклеотидов за прогон, а тогда ведь Applied Biosystems использовались. То есть около 500 нт на дорожку, не могли же они 200 дорожек гнать одновременно? Или в HGP были такие машины?