shvarz: (Default)
shvarz ([personal profile] shvarz) wrote2012-09-11 11:48 am

Новости с конференции

Из интересного за последние два дня:


  • Когда в 2009 году были оглашены результаты испытания ВИЧ вакцины в Тайланде, многие им не поверили, потому что различия между плацебо и вакцинированной группами (30%) были довольно слабыми со статистической точки зрения - буквально на границе стат-значимости и только при использовании незапланированного в изначальном плане анализа. Потом в 2011 году анализ образцов крови показал, что иммунный ответ к району V2 в белке оболочки коррелирует с защитой от вируса. Это указывало на то, что вакцина действительно работает, но корреляция была довольно слабенькая. В этом году Моргейн Ролланд проанализировала геномы вирусов из зараженных людей и нашла, что отличия между вирусами из плацебо и вакцинированной групп тоже находятся в районе V2. Учитывая, что два независимых анализа указывают на один и тот же район в вирусе, теперь не остается почти никаких сомнений в том, что вакцина действительно была эффективна.

  • Группа Беатрис Хан какое-то время уже наблюдает за дикими шимпанзе в Африке. Недавно они показали, что инфекция ВИО в шимпанзе патогенна и ведет к повышенной смертности. С тех пор они сделали аутопсию нескольких трупов и нашли в них типичные признаки СПИДа - пониженное количество CD4 клеток, оппортунистические инфекции. Более того, некоторые популяции изрядно пострадали от вируса - численность за последние 10 лет снизилась на 50-70%, большинство из смертей связано с вирусом. До сих пор ни один из детенышей, рожденных у ВИО-зараженных самок, не выжил. Что с этим делать, не совсем понятно. Беатрис предлагает искать способы для биомедицинского вмешательства.

  • Одной из самых первых протестированных (на обезьянах) вакцин был аттенуированный ВИО с делецией в гене nef. Эта вакцина до сих пор остается самой эффективной из всех опробованных, но как именно она работает никто толком не знает. Группа Эшли Хааса уже довольно давно очень тщательно в этом копается и последние их данные очень интересны. Вакцинированные таким образом макаки в ответ на вирус выделяют цитокины подавляющие воспалительные процессы и иммунный ответ. В результате вирус оказывается лишен активированных клеток-мишеней и не может эффективно размножаться. Почему вакцинация ведет к подобному ответу не совсем понятно, но данные Хааса указывают на то, что у этих макак в слизистых находятся специальные B-клетки, которые постоянно выделяют огромные количества антител и ингибирование иммунного ответа вызывается детекцией вируса покрытого антителами.

  • В тему с пунктом выше: Джейкоб Естес и Брендон Киил заражают макак интравагинальной инокуляцией вируса, потом через несколько дней режут их на мелкие кусочки и таким образом наблюдают самые ранние стадии инфекции. Одна из вещей, которую они таким образом заметили - начальное гнездо инфекции практически всегда находится в районе локального воспаления. В таких местах никаких микро-трещинок не надо, там эпителий тонкий, а CD4 клеток столько, что они буквально вываливаются наружу за пределы эпителия, что и позволяет вирусу начать инфекцию.

  • При грудном вскармливании новорожденный имеет довольно высокий риск инфекции от ВИЧ+ матери (10-15%). Как это происходит не совсем понятно, особенно - какие именно клетки заражаются в первую очередь. ВИЧ предпочитает заражать активированные CD4 клетки памяти, которых у новорожденных по идее должно быть очень мало или не быть вообще (они же еще не встречались с инфекциями, а от матери они не передаются). Маделин Бандерс посмотрела на образцы кишечника полученные при аутопсии новорожденных, умерших от болезней не связанных с ВИЧ. Там она нашла большое количество СD4 клеток, которые не являются клетками памяти, но во многом на них похожи и должны быть хорошими мишенями для вируса. Что это за клетки и откуда они берутся пока непонятно.

[identity profile] farwideserenity.livejournal.com 2012-09-11 04:43 pm (UTC)(link)
потрясающе, большое спасибо.

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-11 06:01 pm (UTC)(link)
ВИО у шимпанзе, чем не модель развития ВИЧ без лечения и профилактики.

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-11 06:04 pm (UTC)(link)
Социология несколько отличается :)

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-11 06:14 pm (UTC)(link)
Неужели Вы про моногамность?

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-11 06:15 pm (UTC)(link)
Да нет, много чего еще отличается. Неужели не очевидно?

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-11 06:33 pm (UTC)(link)
Согласен, меня просто поразило:
последние 10 лет снизилась на 50-70%

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-11 06:45 pm (UTC)(link)
А, да - удивительно, что так сильно.

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-11 06:49 pm (UTC)(link)
Это, кстати, те самые шимпанзе, которых Гудалл изучала. Если они вымрут, то будет вдвойне обидно.

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-12 05:02 am (UTC)(link)
К вмешательству: вакцины нет, терапия для шимпанзе не применима. Что остается, "карантинные" меры?

Если ВИО выкосит всю популяцию - это будет тупиком для вируса...
ext_605364: geg MOPO4 (geg_MOPO4)

[identity profile] gegmopo4.livejournal.com 2012-09-12 08:01 am (UTC)(link)
Это будет большая потеря для науки. Даже если вид удастся спасти — хана всем наблюдениям за дикими шимпанзе в дикой природе.

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-12 02:26 pm (UTC)(link)
Это было в контексте работ по созданию AAV векторов, экспрессирующих антитела широкого действия. Дескать это может сработать.

На самом деле мне кажется карантинные меры вполне возможны - они отлично знают какие из шимпанзе в группе заражены. Можно их отловить, отвезти в зоопарк и посадить на терапию.

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-12 06:16 pm (UTC)(link)
Ну или хотя бы локально изолировать.

[identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com 2012-09-12 07:51 pm (UTC)(link)
>Можно их отловить, отвезти в зоопарк и посадить на терапию.

можно. платить кто будет?

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-12 07:52 pm (UTC)(link)
March of dimes - шимпанзе все любят.

[identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com 2012-09-12 07:59 pm (UTC)(link)
больных? как то мне сомнительно

да, впрочем и здоровых тоже. их содержать дорого. в большом зоопарке они может и окупают себя, ну так в больших зоопарках уже свои обезьяны есть. а взрослый, дикий да еще и заведомо больной кобель шимпанзе... нафигаж им такое счастье?

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-13 12:12 am (UTC)(link)
Я тут паре девушек проблему описывал, так это было сплошное ми-ми-ми. Они же на знают, что это взрослый дикий зверь.

Но стоить будет порядочно, да. С другой стороны, предлагаемая альтернатива - разработать для них доставляемую вирусом кассету с антителами - стоит тоже не мало.

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-13 04:50 am (UTC)(link)
Кобелю шимпанзе можно сделать обрезание кастрировать
Edited 2012-09-13 04:51 (UTC)

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-16 06:06 pm (UTC)(link)
Егор, нет ли у Вас ссылки на проблему спасения шимпанзе, возможности, проблемы, мб что полезное найду...

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-16 06:27 pm (UTC)(link)
См. публикации Beatrice Hahn насчет того, что ВИО вызывает у них СПИД. Мы все презентации с конференции выкладываем в сеть, но это была не сама конференция, а satellite - там организаторы решают выкладывать в сеть или нет. Больше не знаю где посмотреть.

Что остается, "карантинные" меры?

[identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com 2012-09-12 05:45 pm (UTC)(link)
Презервативы раздать.

Re: Что остается, "карантинные" меры?

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-12 05:48 pm (UTC)(link)
Или католических священников заслать.

Re: Что остается, "карантинные" меры?

[identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com 2012-09-12 07:54 pm (UTC)(link)
лучше и то, и другое. должен же быть выбор у обязьянков

Re: Что остается, "карантинные" меры?

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-12 06:15 pm (UTC)(link)
Хорошо, что ВИО кровососами не передается, иначе пришлось бы ОЗК напяливать.

Re: Что остается, "карантинные" меры?

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-13 12:12 am (UTC)(link)
Хорошо, что ВИЧ кровососами передается, иначе некому бы уже было эти ОЗК производить.

Re: Что остается, "карантинные" меры?

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-13 03:24 am (UTC)(link)
Поправтье, НЕ передается (вдруг кто процитирует).

Re: Что остается, "карантинные" меры?

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-13 12:12 pm (UTC)(link)
Поправить не могу, но действительно НЕ передается.

[identity profile] stratin.livejournal.com 2012-09-11 06:09 pm (UTC)(link)
А есть разница, если кормят грудью или дают сцеженное молоко?

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-11 06:11 pm (UTC)(link)
Интересный вопрос. Не знаю.
etoile_verte: (yasen)

[personal profile] etoile_verte 2012-09-11 06:36 pm (UTC)(link)
Интересно, хотя и не очень понятно. Слабенькая эффективность — это как? Защищает, но мало людей, защищает много людей, но не очень хорошо?
Макак жалко :)

Аутопсия — вроде бы по-русски это всё ещё вскрытие.
Делеция — с болью в сердце и посмотрев в словарь, вынуждена признать, что такое слово есть, исключительно внутри биологии :) Это значит, что у вируса выключен ген nef, да?
Ну и перед «подавляющие» запятая, но это уже так :))

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-11 06:48 pm (UTC)(link)
Ну по-максимуму давала 60% защиту, но совсем недолго, буквально полгода. В конце испытания (через 3 года) получилось 30% снижение вероятности инфекции.

Да, делеция nef - из гена nef вынут кусок, так что этот ген больше не производит этот белок.
etoile_verte: (yasen)

[personal profile] etoile_verte 2012-09-11 06:53 pm (UTC)(link)
Ага, понятно. Полгода и правда мало совсем :(

[identity profile] paxmet.livejournal.com 2012-09-12 07:11 am (UTC)(link)
Прошу прощения, что вмешиваюсь, но "аутопсия" по-русски - это вполне нормально, так говорят и пишут. А "делецию" ничем не заменишь, термин.
etoile_verte: (yasen)

[personal profile] etoile_verte 2012-09-12 10:43 am (UTC)(link)
Говорят, пишут... это не аргумент, но в словаре действительно есть. Это действительно вскрытие, и так куда понятнее. Делецию тоже лучше заменить не термином, а фразой-пояснением. Я явно вижу это слово впервые, а ситуации с выключением гена неоднократно встречала в разных научно-популярных блогах, благодаря чему имела возможность предположить, что сей невиданный термин означает :) Так что я больше о популярности.

[identity profile] paxmet.livejournal.com 2012-09-12 11:22 am (UTC)(link)
Тут вопрос в том, какую задачу ставит перед собой автор. Как по мне, так вся запись далека от популярного уровня для неподготовленного читателя. Много что требует пояснения, и делеция (в школьной программе этого разве не было?) с аутопсией - ещё не самое страшное :)

P.S. Кстати, коль уж на то пошло, делеция - это не выключение, а выпадение участка хромосомы. То есть, это структурное, а не функциональное изменение. Впрочем, результат тот же - кодируемый признак отсутствует.
Edited 2012-09-12 11:26 (UTC)
etoile_verte: (yasen)

[personal profile] etoile_verte 2012-09-12 11:31 am (UTC)(link)
Да нет, остальное более-менее понятно, на том уровне, на котором я пытаюсь понять :) Как подготовленный другими популярными блогами и википедией читатель, конечно.
Ой, ну не на-адо про школьную программу, на меня от этого слова уже икота нападает. Вы же не знаете, в каком году, в какой школе и в какой стране я закончила школу. Страшные слова «дистрибуция» и особенно «промоция» я точно услышала уже в институте, а делеция... какая в школе делеция? Горох помню, митоз, мейоз и кроссинговер :) Учебнику не менее 10 лет на тот момент было точно.

Мне кажется, аутопсию я встречала только в англоязычных фильмах, то есть по-английски, и лазила за ней в словарь. В детективах пишут «вскрытие», ну или писали лет 10 назад, когда я перестала их читать.

[identity profile] paxmet.livejournal.com 2012-09-12 12:10 pm (UTC)(link)
Да, школы бывают разные - это точно. У меня наблюдается такой глюк: не всегда помню, что учили в школе, а что в медицинском институте. Поэтому иногда путаю, что более или менее общеизвестно, а что - сугубо медицинская фишка.

"Аутопсия" используется в русскоязычной медицинской среде наравне со словом "вскрытие". Хотя, конечно, этот термин более "профессиональный".

Меня удивляет, что все нынче знают, что такое, например, аттенуированный штамм (в школе этого точно не учили). Впрочем, со всеми этими шумихами вокруг вакцин - немудрено :)
etoile_verte: (yasen)

[personal profile] etoile_verte 2012-09-12 12:18 pm (UTC)(link)
По моим наблюдениям, этот глюк у всех, кто изучал в институте предметы, которые есть и в школе (я по образованию менеджер, и общей со школьными предметами у нас была только история Украины, кажется), но вы первая на моём веку, кто в курсе его существования :) Респект.

Надо же. Мои родители медики, но не патологоанатомы, так что никогда от них не слышала. Зато это позволяет мне кривиться на «ставить уколы» и поправлять на «делать инъекции!» :)

Я не знаю, что такое аттенуированный штамм :) Но я помню, что глагол attenuate — это что-то про уменьшать, стало быть, ослабленный вирус?

[identity profile] paxmet.livejournal.com 2012-09-12 12:20 pm (UTC)(link)
Абсолютно верно :)
А за респект спасибо. Я в определённой мере эксперт по глюкам. По крайней мере, по собственным ;)
Edited 2012-09-12 12:21 (UTC)

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-13 03:28 am (UTC)(link)
Если быть совсем занудой, лучше применить термин некропсия, ибо не человека же вскрывали.

[identity profile] paxmet.livejournal.com 2012-09-13 06:30 am (UTC)(link)
Насколько я понимаю, это синонимы. Хотя лично мне как раз термин "некропсия" никогда не встречался.
Edited 2012-09-13 06:31 (UTC)

[identity profile] rusty-spur.livejournal.com 2012-09-13 06:55 am (UTC)(link)
Я не буквоед, но просто тему поддержать
In practice, it seems that "autopsy" is generally used when referring to the post-mortem examination of a human body, and "necropsy" refers to the examination of non-human bodies

ну и в документах обычно пишут necropsy

[identity profile] paxmet.livejournal.com 2012-09-13 07:27 am (UTC)(link)
Ах, да, у нас же тут обезьяны! Вы правы :)

[identity profile] vadim-proskurin.livejournal.com 2012-09-11 07:29 pm (UTC)(link)
инфекция ВИО в шимпанзе патогенна и ведет к повышенной смертности
Именно ВИО, не ВИЧ? Или здесь подразумевается, что ВИЧ - как бы подмножество ВИО?

[identity profile] shvarz.livejournal.com 2012-09-11 07:52 pm (UTC)(link)
У них свой вирус, не ВИЧ. Точное название SIVcpz.

[identity profile] medgyna.livejournal.com 2012-09-11 07:47 pm (UTC)(link)
Спасибо, очень интересно. И очень жалко шимпанзе - вымрут ведь...

[identity profile] paxmet.livejournal.com 2012-09-12 07:11 am (UTC)(link)
Спасибо :)