![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
Entry tags:
Новости сиквенирования
Конкуренты уже обсуждавшихся опубликовали в Nature статью (в открытом доступе): A map of human genome variation from population-scale sequencing
Нефункциональных генов в каждом человеке: 250-300, к сожалению частоту нефункциональных гомозигот не приводят (к этому)
Частоту мутаций оценивают с большой точностью: 1-1.2x10-8
Между разными популяциями людей существуют отличия по частоте встречаемости нескольких сотен тысяч мутаций (при этом Fst довольно низкий, я не совсем понимаю как такое может быть и что это значит). И большинство этих мутаций меняют последовательность аминокислот, что говорит о быстром и интенсивном естественном отборе (к этому).
Нефункциональных генов в каждом человеке: 250-300, к сожалению частоту нефункциональных гомозигот не приводят (к этому)
Частоту мутаций оценивают с большой точностью: 1-1.2x10-8
Между разными популяциями людей существуют отличия по частоте встречаемости нескольких сотен тысяч мутаций (при этом Fst довольно низкий, я не совсем понимаю как такое может быть и что это значит). И большинство этих мутаций меняют последовательность аминокислот, что говорит о быстром и интенсивном естественном отборе (к этому).
no subject
это на нуклеотид на поколение?
no subject
no subject
в какую сторону? :)
no subject
no subject
Меня это удивляло "сИквенс", но "сЕквенировать".
no subject
Я этой статье в свое время не поверил. Но после открытия редактирования мРНК задумался, что может такое и может быть.
В общем все не так просто, как нас учили в университете.
no subject
И сиквенс и секвенировать уже устоялись, между ними идет борьбы. Я а пишу как бог на душу положит.
no subject
no subject
no subject
no subject
1000 геномов
«Перевалило за тысячу: третья фаза геномики человека (http://biomolecula.ru/content/750)»:
Лишь десять лет назад всего двух пальцев было достаточно, чтобы сосчитать отсеквенированные человеческие геномы. В прошлом году для этого нужны были уже пальцы двух рук. Однако сейчас уже непонятно, найдётся ли нужное количество пальцев в роте солдат, чтобы продолжать вести такой подсчёт. Исследовательский консорциум «1000 геномов (http://www.1000genomes.org/)» сообщает о завершении «пилотной» фазы проекта, в которой получено 179 полных генетических последовательностей, ещё для почти 700 индивидуумов «прочли» только кодирующие участки ДНК, а для двух групп родители–ребёнок (получается, ещё шесть геномов) секвенирование выполнили с особенной тщательностью, чтобы изучить скорость возникновения мутаций. Персональная генетическая медицина всё продолжает приближаться.
no subject
Хорошо бы принудить какого-нибуть математического статистика почитать эту работу и рассказать потом, что он думает про точности оценок, методы их получения и прочие p-value.
no subject
(З.Ы: Клеточными линиями называют все-таки эукариотические клетки, там же речь идет о еколях.)
no subject
....
We infer that the remaining vast majority (952 CEU and 634 YRI) of the validated variants were somatic or cell line mutations. The greater number of these validated non-germline mutations in the CEU cell line perhaps reflects the greater age of the CEU cell culture.
no subject
no subject
присоединяйтесь: http://macroevolution.livejournal.com/38950.html
no subject
Ссылку посмотрю, но Кондрашев там с первых же строчек в карьер начинает нести ерунду.
no subject