shvarz: (Default)
[personal profile] shvarz
Я думал, что открытый недавно мимивирус - это курьез природы. Вирус, с геномом в более миллиона нуклеотидов и размером в 500 нм, покрупнее некоторых бактерий. Вот тут, однако, пишут, что секвинирование образцов океанской воды поставило их вторыми по численности вирусами после бактериофагов. Задним умом, как водится, это имеет смысл - гигантские вирусы живут на водорослях и на поедающих водоросли амебах, а этих тварей на планете огромное количество (а значит и вирусов должно быть дофига). Среди более знакомых нам гирусов (гигантских вирусов) есть лишь вирусы оспы, но они раза в три меньше мимивируса (и по геному и по размеру).

В своих гигантских геномах гирусы чего только не кодируют: и целые метаболические цепочки, и ферменты трансляции, и ферменты гликозилирования белков, и даже метилазы и рестриктазы. Причем они очень часто обмениваются генетическим материалом с хозяевами. Настолько часто, что во многих случаях даже трудно определить, кто у кого гены занял - вирус у хозяина или хозяин у вируса. Если кому интересны детали эволюции гирусов, то спросите у [livejournal.com profile] eugene_koonin, у него недавно обзор вышел на эту тему.

Немного картинок мимивируса:

Это мимивирус. Видна его геометрически-правильная структура и множественные филаменты.


Реконструкция вирусной частицы (без филаментов) на основе усреднения множественных фотографий. На "макушке" у мимивируса - пятиконечная звезда. На нижней серии картинок - срезы в разных частях вируса.


Схема устройства мимивируса.

Date: 2011-02-21 02:34 pm (UTC)
From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com
раз он такой жирный и процветающий, значит наверно есть мелкие вирусы, которые в свою очередь его заражают.

Date: 2011-02-21 03:02 pm (UTC)
From: [identity profile] febb.livejournal.com
Красиво!)
Может он как катализатор или переносчик кодов - ускоряет эволюцию? :)

Date: 2011-02-21 04:00 pm (UTC)
From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com
ага, я уже в вики прочитал. :)

*подумав*

Date: 2011-02-21 04:03 pm (UTC)
From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com
а жаль, что не бывает вирофагов для ретровирусов... очень бы пригодились.

Date: 2011-02-21 04:36 pm (UTC)
From: [identity profile] misha-makferson.livejournal.com
А зачем ему такой огромный геном? Собрал с бору по сосенке, что где попалось?

Date: 2011-02-21 05:24 pm (UTC)
From: [identity profile] overscience-mes.livejournal.com
до чего же они мне нравятся, жаль что какие-то поросята сливки сняли, я бы его цитохром бы поизучала немного...

Date: 2011-02-21 05:45 pm (UTC)
From: [identity profile] ygam.livejournal.com
Натуралистами открыты
У паразитов паразиты.

Date: 2011-02-21 05:49 pm (UTC)
From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com
Паразит моего паразита - мой симбионт!

Date: 2011-02-21 05:51 pm (UTC)
From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com
имею гипотезу, что это позволяет гибко обходить защитные механизмы клеток хозяев и дает выскую вирулентность, типа как у оспы.

Date: 2011-02-21 07:38 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Я думаю, просто потому что он может себе это позволить. Нет нужды все плотно паковать - и так влезет.

Date: 2011-02-21 07:39 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Если их дофига, то и цитохромов должно быть дофига - на всех хватит. Вообще пишут, что около половины рамок считывания кодируют неизвестно что - без аналогов среди известных генов. Изучай - не хочу.

Date: 2011-02-21 07:48 pm (UTC)
From: [identity profile] overscience-mes.livejournal.com
необязательно, кажется, они таскают куски чужих геномов, но идиоты опубликовавшиеся ничего не сделав, раздражают :)

Date: 2011-02-22 12:59 am (UTC)

Date: 2011-02-22 05:36 am (UTC)
From: [identity profile] metarattus.livejournal.com
http://elementy.ru/news/430821

Date: 2011-02-22 05:37 am (UTC)
From: [identity profile] metarattus.livejournal.com
Любой паразит - симбионт.

Правильнее сказать "Паразит моего паразита - мой мутуал"

Date: 2011-02-22 09:21 am (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Поскольку он переносит гены горизонтально, то он однозначно ускоряет эволюцию.

Date: 2011-02-22 09:24 am (UTC)
From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com
спасибо, очень интересно!

Date: 2011-02-22 03:53 pm (UTC)
From: [identity profile] febb.livejournal.com
Вот эта стыковка биологии, эволюции и информатики наверное самая интересная и динамичная область научного естествознания. Поражает воображение, какой путь проделала жизнь за миллиарды лет...

Я смотрю на это с инженерской и дизайнерской точки зрения. Удивительно.

Date: 2011-02-22 07:41 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
Это как это? Амёба то сдохла.

Свою эволюцию вирус может и ускоряет, а может и нет. Смотря как считать.

Date: 2011-02-22 07:47 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
А бегемот зачем большой?

Date: 2011-02-22 08:12 pm (UTC)
From: [identity profile] misha-makferson.livejournal.com
Работа такая.

Date: 2011-02-22 08:30 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
Откуда у бегемота работа? Он же не верблюд.

Date: 2011-02-22 08:33 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Какая сдохла, а какая и нет. Откуда эндогенные вирусы берутся?

Date: 2011-02-22 08:35 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
С инженерийной и дизайнерской точки зрения удивительно скорее даже не это, а то, что "вся эта хрень работает". Потому как принцип именно такой - "лишь бы работало" и инженерные решения там очень даже корявые местами.

Date: 2011-02-22 08:35 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
На акул охотиться, вестимо.

Date: 2011-02-22 08:54 pm (UTC)
From: [identity profile] febb.livejournal.com
Да, именно работает каким-то чудом. Заложены довольно суровые параметры: значительный процент организмов должен умереть. Но это природе не важно, важна статистическая выживаемость в целом в некотором диапазоне условий к которым приспособлено. А вот изменение условий часто фатально для целых видов. Но и это вообщем никого не колышет. Жизнь в целом цветет и пахнет.

Интересен цыфровой аспект жизни. Природа давно перешла от аналоговой к цифровой технологии. Хотя в узкой области наследственности. Но и здесь удивительный пофигистский подход - мешанина генов. Такой бешсабашный творческий процесс.. :)

Насчет компромиссности дизайна. Гугль недавний проект 3D анотомический проэкт Body. Удивительный биологический робот.
Начинка и компоновка деталай изумляет имеено тем что 100 лет может безотказно работать самоподдерживаться, хотя казалось столько уязвимых мест, но в целом машина страшно живучая!

Date: 2011-02-22 08:58 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
А эндогенные вирусы такими здоровыми бывают? Я не встречал упоминаний, что бы их в амебном геноме находили, только про наоборот -- из амебных куски в ихнем. Но у амебы, конечно, много ДНК в клетке. Есть где спрятаться.

Date: 2011-02-22 09:02 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Не знаю, бывают или нет. Это была иллюстрация общего принципа, что "не все что заразилось - обязательно сдохнет". И целиком вирусу встраиваться не обязательно (тем более, что мимивирусы цитоплазматические), достаточно просто рекомбинации отдельных кусков.

Date: 2011-02-22 09:46 pm (UTC)
From: [identity profile] misha-makferson.livejournal.com
Бегемот работает бегемотом :-)

Date: 2011-02-22 10:58 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
Что то я не понял. Что с чем в амебной цитоплазме рекомбинирует так, что результат для амебной эволюции будет иметь значение?

Date: 2011-02-22 10:59 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
В зоопарке. А большой он -- везде.

OFF

Date: 2011-02-22 11:31 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
А вот это Вы видели? У него целый сайт есть.
http://www.ng.ru/science/2010-01-27/14_aids.html

Date: 2011-02-23 12:54 pm (UTC)
From: [identity profile] misha-makferson.livejournal.com
На акул это морские бегемоты. Пресноводные на крокодилов.

Date: 2011-02-23 07:11 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
Ну, там ведь RNA вирус не токсичный, и у него один очень специальный элемент в геном влазит. Т.е. это, конечно, интересно, что не только ретровирусы могут следы в геноме оставлять.

Date: 2011-02-23 11:32 pm (UTC)
From: (Anonymous)
Так ведь там и вирус, который обычно репродуктивные органы не поражает, и масштабы процесса (общее количство инфекций в год) на многие порядки меньше.

При вирусной инфекции много что может произойти - вирус дефектный попадется или застанет клетку в процессе деления или антивирусные механизмы сработают, но не до конца. Факт тот, что вирусы новый генетический материал туда-сюда таскают, а значит и горизонтальный перенос генов будет.

Date: 2011-02-23 11:36 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Это я был.

Re: *подумав*

Date: 2011-02-24 03:31 pm (UTC)
From: [identity profile] potan.livejournal.com
Что мешает сделать?
ДНК синтезировать нунче не очень дорого :-).

Re: *подумав*

Date: 2011-02-24 03:35 pm (UTC)
From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com
ЕМНИП так пробовали ВИЧ лечить - что-то там не сростается.

Re: *подумав*

Date: 2011-02-24 03:46 pm (UTC)
From: [identity profile] potan.livejournal.com
Про такой, с созданием противовируса, метод, я еще не слышал :-).

Re: *подумав*

Date: 2011-02-24 04:27 pm (UTC)
From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com
Не помню подробностей, они пытались вывести из самого HIV-а штамм, который симбиотичен в клетке и тормозит размножение диких.

Date: 2011-09-30 11:42 pm (UTC)

March 2022

S M T W T F S
  12345
6789101112
13141516171819
20212223242526
2728293031  

Most Popular Tags

Page Summary

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Feb. 24th, 2026 04:28 am
Powered by Dreamwidth Studios