О тайнах ПЦР

[shvarz]

Кому поржать, кому поплакать...

Высококвалифицированная "врач" Ольга Ковех, советующая ВИЧ-положительным людям не лечиться от "выдуманного ВИЧ", пытается разобраться в тонкостях загадочной методики ПЦР:

Сначала копи-пейст откуда-то:
При подготовке пробы крови для ПЦР анализа в ней разрушают все белки с помощью добавления специальных ферментов протеаз, липиды с помощью детергентов, полисахариды и прочее, оставляя в целостности лишь нуклеиновые кислоты и освобождая их от связанных с ними белков. В таких условиях структурные белки вирусных частиц тоже разрушаются и вирусная РНК выходит наружу. Здесь ее выявляют методом ПЦР с помощью специальных зондов, узнающих определенную последовательность нуклеотидов

Затем Ольга использует свои познания в клеточной и молекулярной биологии
"Теперь читаем строение ядра. Там сказано, что ядрышки - это есть рибосомы, состоящие из РНК. Хромосомы состоят из ДНК, но если они распадаются на две отдельные цепочки, то получается - ТА ЖЕ РНК!!! И так, отсюда вывод - ЕСЛИ РАЗРУШАЕТСЯ ЯДРО КЛЕТКИ ( а оно разрушается потому что имеет такую же оболочку, что и все остальные структуры- липопротеидную ), то РНК РИБОСОМ и РАЗОРВАННЫЕ И РАСКРУЧЕННЫЕ СОСТАВНЫЕ ЧАСТИ ХРОМОСОМ МОГУТ БЫТЬ ПРИНЯТЫ ЗА РНК - ВИРУС!!!!
Рибосомы так же содержатся в цитоплазме всех клеток. Теперь представьте что будет, если все клетки разрушить, и начать проводить тест на выявление РНК - вируса! Все ЭТО будет тестировано как ВИРУС!"



Чуть позже
Прочитала как делается метод ПЦР , делаю вывод что методика настолько сложна и имеет столько технических сложностей, что малейшее несоблюдение температурного режима по стадиям выделения, условий транспортировки, допустимых сроков использования образцов, условий центрифугирования - и тест считается недействительным. А дальше в конце процедуры заключение делает сама аппаратура. Заключение делается по регистрации флюоресцентного сигнала ( свечения) чего-то там... Этот сигнал должен накапливаться. И дальше самое интересное. Тест считается положительным, если количество этого сигнала находится в строго определенном диапазоне. Написано - ДО 40! Это будет + тест на ВИЧ. Что написано дальше не поддается никакой логике . Оказывается, что если количество этого флюоресцентного сигнала будет больше 40 то тест будет ОТРИЦАТЕЛЬНЫМ!И он будет отрицательным так же, если его вообще не будет этого сигнала ( не определяется). Я этого вообще не могу понять. Если больше - значит больше того что исследуется. Почему если сигнал до 40 то +, а выше 40 - следует считать минус???

(примечание для тех, кто не понял: ольга читала про real-time PCR. Вкратце - принцип метода таков, что чем меньше исходного материала было в образце, тем выше будет число. "Не поддается никакой логике" почему ниже 40 - результат положительный, а выше - отрицательный...)

В пункте 8.1. 3 и 8. 2. 2 описывается что должно происходить в контрольных пробирках. Там написано следующее, что если в ней количество этого флуоресцентного сигнала больше чем в 2 раза от какой-то средней величины, то это значит что произошла кантаминация ( заражение из вне , а возможно заражение на фоне разложения сыворотки), и сыворотку следует считать не пригодной, и анализ нужно переделать. Мне не понятно чем отличается заражение биопрепарата из вне( кантаминация), от заражения на фоне заболевания? Почему если этот показатель выше определенных цифр, то тест следует считать недействительным? И почему в контрольных пробирках такое вообще возможно??? Значит существует такой момент, когда в контрольных образцах может идти патологическая реакция! И эта реакция, ГЛАВНОЕ, не будет связана с ПРИСУТСТВИЕМ ВИРУСА, А СВЯЗАНА С ЧЕМ -ТО ДРУГИМ!

Шайтан-методика, однозначно! Негативные контроли использует...

Upd: Еще про эту же группу, чтобы лишний пост не создавать.

Comments

[foma-puhov.livejournal.com]

Any sufficiently advanced technology is indistinguishable from magic))

[shvarz.livejournal.com]

It's really not that advanced. At least not the basic principle.

[irrelative.livejournal.com]

Что-то я запутался. А зачем использовать qPCR для диангостики инфекции?
Или это она сама придумала?

А! Она, что ли, перепутала Reverse Transcription PCR с Real Time PCR? Если так, то это, в принципе простительно для того, кто такими вещами не занимается. И во многом лежит на совести тех, кто продолжает использовать одну и ту же аббревиатуру для обозначения разных методик.

Хотя, конечно, если что-то критикуешь, то хорошо бы разобраться, что именно критикуешь...

[shvarz.livejournal.com]

У них (диссидентов в этой конкретной группе) все просто свалено в одну кучу. И диагностика и лечение - "это все сплошное вранье". Диссиденты обычно напирают на то, что тесты на ВИЧ детектируют антитела к ВИЧ, а не сам вирус. Аргумент дурацкий, но часто им отвечают что вот посмотрите на ПЦР - он детектирует собственно вирус. И пошла-поехала, им надо показать, что ПЦР это шайтан-арба, как ездит - непонятно, что привозит - неизвестно.

[kotvaska16.livejournal.com]

О, я плакала. Рыдала просто-таки.
Особливо про цикл выше 40го, при котором ей надо плюсики рисовать. Мааамо:) "Читаю книгу, вижу фигу". Человек вообще не понимает механизм процесса, похоже. Вообще, так бывает, что 33-35 уже отрицательный, правда, не уверена, в каком конкретно определении.

Контаминация через "а" тоже доставила, и общее понимание, что это:) И откуда берется:)

Какая боль!:):):):)

[shvarz.livejournal.com]

Мне кажется ДНК, которая распадается на РНК - это самый шедевр.

[kotvaska16.livejournal.com]

Тут меня просто заступорило. Ибо непредставимо:)
Двухцепочечная ДНК при разделении на отдельные комплементарные цепи превращается в элегантные брюки РНК. Вот мне интересно, каким ебразом на рибозы этот оаш садится при разваливании-то?

в том же абзаце кстати, ежли я ее правильно поняла, она выдает гениальную мысль, что любая РНК будет принята за вирусную просто по причине того, что она РНК.

[shvarz.livejournal.com]

Да, именно так. Раз ПЦР ищет вирусную РНК, то любая найденная РНК будет считаться вирусной.

Одна из причин, по которой разных фриков стоит почитывать, это для того, чтобы быть более-менее знакомым с их бредовыми идеями. Потому что когда в первый раз такое слышишь, то в полный ступор впадаешь от глубины невежества и даже трудно сразу сориентироваться что в ответ можно сказать.

[kotvaska16.livejournal.com]

У меня такое тихое подозрение, что эти самые фрики - зеркало представлений общественности о той же realtime-PCR да и вообще о том, что есть ДНК и РНК, в чем их отличие и тд.

И это пугает.

[cn-mangetsu.livejournal.com]

методика настолько сложна и имеет столько технических сложностей, что малейшее несоблюдение температурного режима
/me вспомнил по разработку каких-то товарищей, тупо гоняющую раствор по кругу через капилляр переменного сечения с подогревом.

Н-да. „Врач“ Ольга действительно не поддаётся логике. Ещё „кантаминация“ прекрасна.

[wordsmsdnua.livejournal.com]

нельзя разбираться с предметом критики, иначе критика может не получиться.

[foma-puhov.livejournal.com]

Это цитата из Артура Кларка))
http://en.m.wikipedia.org/wiki/Clarke's_three_laws

[shvarz.livejournal.com]

Я в курсе.

[asund.livejournal.com]

Ну, судя по вконтакту, дама увлеклась уже другим - теперь её волнует, что "США-спонсор мирового терроризма" и вдохновляет её депутат Федоров.
Замечательно.

[gleb-kudr.livejournal.com]

Должна существовать процедура лишения таких врачей дипломов и запрещения им практики по причине утраченных знаний и приобретенного маразма. Если они действительно врачи.

Вспомнил, кстати, одну из групп студентов-медиков третьекурсников. Некоторых из них не знали зачем в клетке ядро, да. А потом небось плакались между собой, как зверствует препод.
Ну хрен с ними с биологами какими-нибудь. Но эти-то людей лечить будут!

[arachanski.livejournal.com]

Общественность таких слов вообще не знает.

[overscience-mes.livejournal.com]

мрак, точнее "тьма египетская" (тм)

[luybu.livejournal.com]

Вот вы стебаетесь, нет бы околонаучное руководство написать для Оленьки и ей подобных

[shvarz.livejournal.com]

Чем ДНК от РНК отличается сейчас в школе проходят, да и в сети полно вполне популярных объяснений, мое руководство погоды не сделает.
В том, как real time PCR работает при желании тоже разобраться можно из интернетных материалов. Речь как раз о том, что нет его, этого желания разобраться. Да и не поверят они мне, я у них прохожу под рубрикой самых отъявленных злодеев.

[shvarz.livejournal.com]

Это особо удачный экземпляр попался, но вообще там все примерно на этом уровне.

[shvarz.livejournal.com]

Очень страшное слово. Может идти патологическая реакция!

[shvarz.livejournal.com]

Это все рядом лежит. Антивакцинаторство туда же. И гомеопатия всякая. Одного поля ягоды. "От нас скрывают"

[shvarz.livejournal.com]

Я сомневаюсь, что она где-либо сейчас практикует действительно как врач. Насколько я понял, она "целительствует" и всякой гомеопатией занимается.

[2myshki.livejournal.com]

спасибо, поржал, не могу удержаться...

ПС если вы вдруг не читали Logic of chance Евгения Кунина (Eugene Koonin) - очень очень рекомендую, не могу просто оторваться...

[kotvaska16.livejournal.com]

ПЦР-то может и не знает, а вот ДНК и РНК - знает, зараза, но не знает значений.

[rusty-spur.livejournal.com]

Бгг, еще в марте сг было замечено поредение их рядов
http://rusty-spur.livejournal.com/44941.html

[metarattus.livejournal.com]

В science_freaks запостите, pls. Пусть народ порадуется.

[cn-mangetsu.livejournal.com]

Паталагическая, я настаиваю. Что ж вы такой тёмный-то?

[kodak2004.livejournal.com]

Гггг, отлично :)

[wordsmsdnua.livejournal.com]

Это не смешно, весьма весомый процент критики которую я читал, либо критикуемый предмет знает поверхностно, либо основана на игнорировании каких-либо неугодных фактов, либо критикует не актуальную версию этого предмета, например критика теории эволюции, критикуют дарвина, а то что современная теория эволюции сильно отличается от дарвиновской версии, это игнорируется. Или вот радиоуглеродный анализ, берут его в состоянии 1970-80хх годов и критикуют, а то что сейчас на дворе 2014 и все поменялось игнорируется.

[junka79.livejournal.com]

Я рыдала...пат сталом!
Превращение ДНК в РНК - перл!

[hoegni.livejournal.com]

И очень просто. Про отличия ДНК и РНК дама знает только то, что ДНК - двухцепочечная, а РНК - одноцепочечная. Следовательно, хмм... ну, тут сложнее. По мнению дамы, при разрушении ядра цепочки ДНК обязаны расходиться. А так как различие в одно- или двухцепочечности, то расхождение автоматом превращает ДНК в РНК.

[velta-1.livejournal.com]

Порвало расплетание ДНК с образованием РНК.

[kotvaska16.livejournal.com]

Хм, да....мне эту логику не понять все равно. Как дыры в знаниях затыкать "я сама додумала, что значит этот термин"?
Не, такая логика. она не для средних умов;)

[true-stranger.livejournal.com]

Как говорится "хум хао". Для некоторых и бином ньютона непостижим, только вот каким образом такие люди попадают в "авторитеты" не понятно.

[true-stranger.livejournal.com]

У меня была брошурка, изданная под эгидой Казначеева, где призывали избавляться от митохондрий путем пивных компрессов, а сами митохондрии объявлялись свободно живущими в организме паразитами и их скопления связывались с отеками и опухолями.

Но распадение ДНК на РНК это все же круче. Тут народ старается, на всякие реверс транскриптазы деньги лабораторные тратит, а оно вона как! Это ж просто открытие!

Еще интересно, вот ДНК она тяжелее РНК, куда излишний вес девается? Переходит в тепло по формуле ЭмСиКвадрат? Это ж новый источник энергии!

[kodak2004.livejournal.com]

Это все понятно, просто у вас хорошо получилось передать смысл одной лаконичной фразой :)

[kodak2004.livejournal.com]

Off: уже видели (http://retractionwatch.com/2014/06/20/hiv-vaccine-researcher-who-faked-data-arrested-faces-felony-charges/), кстати?

[hoegni.livejournal.com]

Вы, наверно, зачеты и экзамены никогда не принимали. Там и не такого наслушаешься.

[shvarz.livejournal.com]

Я видел когда его поймали на этом, о том что арестовали - не знал.

[kotvaska16.livejournal.com]

Нет, конечно, я только до диплома дошла, аспирантуру уже не потянула:) Так что только сдавала, то есть, сама ляпала;)

[gorrah.livejournal.com]

Мне интересней, откуда при таких вводных у дамы отрос медицинский диплом. Отличие РНК от ДНК на химическом уровне - это средняя школа, 10-11 класс. Да и медики генетику вполне себе изучают. Конечно, во многих медицинских специальностях ее сразу после сдачи можно, увы, забыть без потери квалификации. Далековато еще нам до момента, когда провинциальный терапевт станет спрашивать с пациента результаты ДНК-тестирования. Однако настолько базовые вещи можно забыть, имхо, только если никогда и не знал,

[kotvaska16.livejournal.com]

Средняя школа, 10-11 класс многими мимо проходился. Но вот как отрос диплом - это реально непонятно. Тут же даже не генетика, тут биохимия, которая точно есть у всех медиков в том или ином количестве. И, да, такие элементарные вещи не забудешь, если знал, я с Вам и совершенно согласна. Я хоть и химик, но откуда-то же помню!:)
Возможно, диплом купленный?

[gorrah.livejournal.com]

Дипломы все же обычно покупают не чтобы бескорыстно бороться с мировыми заговорами...
Скорей "человеческая глупость дает прекрасное представление о бесконечности".

[kotvaska16.livejournal.com]

Я не знаю, для чего их покупают - нет выборки:)

[Юра Лящук (from livejournal.com)]

Если не ошибаюсь, недавно она вышла на пенсию. Но на вк, в личках, многих ВИЧ+ "консультирует".