Откуда взялся ВИЧ?
Jun. 4th, 2009 03:00 pmПочему он вдруг перескочил к человеку? Откуда? Как он возник? Тоже часто задаваемые вопросы.
ВИЧ принадлежит к семейству лентивирусов, которые когда-то давно произошли (скорее всего) от дельтаретровирусов. Когда именно - мы точно не знаем, но в геноме кроликов была найдена копия дефектного и довольно примитивно устроенного лентивируса, который попал туда примерно 12 миллионов лет назад. Сейчас лентивирусы распространены среди довольно разных животных - они были найдены у приматов, кошек, лошадей, коров, овец. Лентивирусы приматов (так называемые SIV) - самые новые в этой группе и характеристично отличаются от других лентивирусов отсутствием одного из генов. Среди приматов лентивирусы были найдены уже более чем у 40 видов, но исключительно в Африке, что тоже указывает на их относительно недавнее происхождение (около одного миллиона лет назад).
Такое широкое распространение SIV среди африканских приматов разворачивает вопрос, с которого я начал этот пост, на 180 градусов. Надо спрашивать не почему ВИЧ появился сейчас, а почему он не появился намного раньше? Человек жил в соседстве с этими приматам довольно долго и конечно имел множество шансов подхватить этот (или похожий) вирус. К сожалению, я ничего об этом не знаю и никаких исследований (и даже серьезных гипотез) не нашел.
Особенно это удивительно потому, что на сегодняшний день известно 11 не связанных между собой случаев заражения людей вирусами обезьян. Из них 5 были достаточно успешны, чтобы вызвать глобальную эпидемию. Другие 6 были случаями заражения одного человека и вирус не распространился дальше.
Два из "успешных" вирусов пришли к человеку от дымчатого мангабея (см. картинку). Они попали в человека примерно в одно время, примерно в 1930-1935 годах. Но они не распространились по всему миру, а в основном остались в Западной Африке, но даже и там сейчас их распространение спадает. Два этих вируса называются HIV-2 (группы А и В) и они гораздо реже вызывают СПИД, чем их более известные собратья, собирательно именуемые HIV-1.
HIV-1 попал к человеку от шимпанзе. Интересно, что сами шимпанзе получили этот вирус от двух других обезьян - красноголового мангабея и белоносой мартышки. Вирусы этих двух обезьян перемешались в шимпанзе и уже получившийся вирус попал к человеку (трижды). Самый распространенный (у человека) его вариант был назван группой M, менее распространенный - O, наиболее редкий - N. Кстати, происхождение названий: M=main (основной), O=other (другой), N=neither (ни тот ни другой). Вариант M попал в человека где-то в районе 1905 года, вариант О - около 1920 года, и вариант N - около 1960 года. Вариант М, как самый старый, имел больше времени для эволюции и за прошедшие 100 лет существенно разнообразился. Гены разных его подтипов могут отличаться друг от друга на 30%! Распространение разных подтипов ВИЧ группы М показано вот на этой карте:

Как вы видите, наибольшее разнообразие ВИЧ наблюдается в Африке, как и полагается для эпицентра эпидемии. В 60-х годах в Западной Африке эти подтипы уже существовали (хотя и менее выраженные, чем сегодня). В сохранившихся с того времени человеческих образцах из города Леопольдвиль (нынче Киншаса) были найдены подтипы D и А. То есть вирус довольно долго существовал в Западной Африке не распространяясь за ее пределы. Скорее всего это было вызвано тем, что до 50-60 годов в этих местах практически не было крупных городов и эпидемия "тлела" в небольших изолированных очагах.
В отличие от Африки, практически все развитые страны, были заражены всего одним подтипом вируса - B. Этот подтип мигрировал из Африки на Гаити в середине 60-х годов, отуда через несколько лет попал в Штаты, а уже из Штатов за последующие 10-20 лет распространился по всему цивилизованному миру.
ВИЧ принадлежит к семейству лентивирусов, которые когда-то давно произошли (скорее всего) от дельтаретровирусов. Когда именно - мы точно не знаем, но в геноме кроликов была найдена копия дефектного и довольно примитивно устроенного лентивируса, который попал туда примерно 12 миллионов лет назад. Сейчас лентивирусы распространены среди довольно разных животных - они были найдены у приматов, кошек, лошадей, коров, овец. Лентивирусы приматов (так называемые SIV) - самые новые в этой группе и характеристично отличаются от других лентивирусов отсутствием одного из генов. Среди приматов лентивирусы были найдены уже более чем у 40 видов, но исключительно в Африке, что тоже указывает на их относительно недавнее происхождение (около одного миллиона лет назад).
Такое широкое распространение SIV среди африканских приматов разворачивает вопрос, с которого я начал этот пост, на 180 градусов. Надо спрашивать не почему ВИЧ появился сейчас, а почему он не появился намного раньше? Человек жил в соседстве с этими приматам довольно долго и конечно имел множество шансов подхватить этот (или похожий) вирус. К сожалению, я ничего об этом не знаю и никаких исследований (и даже серьезных гипотез) не нашел.
Особенно это удивительно потому, что на сегодняшний день известно 11 не связанных между собой случаев заражения людей вирусами обезьян. Из них 5 были достаточно успешны, чтобы вызвать глобальную эпидемию. Другие 6 были случаями заражения одного человека и вирус не распространился дальше.
Два из "успешных" вирусов пришли к человеку от дымчатого мангабея (см. картинку). Они попали в человека примерно в одно время, примерно в 1930-1935 годах. Но они не распространились по всему миру, а в основном остались в Западной Африке, но даже и там сейчас их распространение спадает. Два этих вируса называются HIV-2 (группы А и В) и они гораздо реже вызывают СПИД, чем их более известные собратья, собирательно именуемые HIV-1.
HIV-1 попал к человеку от шимпанзе. Интересно, что сами шимпанзе получили этот вирус от двух других обезьян - красноголового мангабея и белоносой мартышки. Вирусы этих двух обезьян перемешались в шимпанзе и уже получившийся вирус попал к человеку (трижды). Самый распространенный (у человека) его вариант был назван группой M, менее распространенный - O, наиболее редкий - N. Кстати, происхождение названий: M=main (основной), O=other (другой), N=neither (ни тот ни другой). Вариант M попал в человека где-то в районе 1905 года, вариант О - около 1920 года, и вариант N - около 1960 года. Вариант М, как самый старый, имел больше времени для эволюции и за прошедшие 100 лет существенно разнообразился. Гены разных его подтипов могут отличаться друг от друга на 30%! Распространение разных подтипов ВИЧ группы М показано вот на этой карте: 
Как вы видите, наибольшее разнообразие ВИЧ наблюдается в Африке, как и полагается для эпицентра эпидемии. В 60-х годах в Западной Африке эти подтипы уже существовали (хотя и менее выраженные, чем сегодня). В сохранившихся с того времени человеческих образцах из города Леопольдвиль (нынче Киншаса) были найдены подтипы D и А. То есть вирус довольно долго существовал в Западной Африке не распространяясь за ее пределы. Скорее всего это было вызвано тем, что до 50-60 годов в этих местах практически не было крупных городов и эпидемия "тлела" в небольших изолированных очагах.
В отличие от Африки, практически все развитые страны, были заражены всего одним подтипом вируса - B. Этот подтип мигрировал из Африки на Гаити в середине 60-х годов, отуда через несколько лет попал в Штаты, а уже из Штатов за последующие 10-20 лет распространился по всему цивилизованному миру.
no subject
Date: 2009-06-04 07:29 pm (UTC)Однажды присутствовал на лекции, на которой рассказывали, что вирус этот появился намного раньше, просто срок жизни был намного меньше, потому никто не обращал внимания. К тому же умирал то человек от какого-либо другого заболевания, которому иммунная система не могла противостоять.
Такое возможно, или лектор врал?
no subject
Date: 2009-06-04 07:41 pm (UTC)Я же вообще имел в виду - почему мы не заполучили его намного раньше - сотни тысяч (миллионы) лет назад?
(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2009-06-04 07:49 pm (UTC)потом случилась авария, Чак Норрис был в отпуске, а Брюс Виллис спасал мир от астероида. вот вирус и вырвался и теперь всем пипец.))
кстати, понятно, что сконструировать жизнеспособный вирус непросто, наверно, пока невозможно. но что мешает заняться "селекцией" наиболее убойных?
no subject
Date: 2009-06-04 07:53 pm (UTC)Вообще SIV был бы очень неочевидным биологическим оружием - он не вызывает у организма-хозяина болезни и передается очень неэффективно. Если уж выводить селекцией наиболее убойных, то надо брать что-нибудь более продвинутое - оспу там, или грипп.
(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2009-06-04 07:59 pm (UTC)no subject
Date: 2009-06-04 08:07 pm (UTC)no subject
Date: 2009-06-04 08:23 pm (UTC)no subject
Date: 2009-06-04 08:32 pm (UTC)Подтип - группа близкородственных вирусов (genetic diversity<20%). Штамм (не уверен в точном значении этого слова в современном русском языке) - один конкретный выделенный вирус.
(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2009-06-04 08:25 pm (UTC)no subject
Date: 2009-06-04 08:50 pm (UTC)no subject
Date: 2009-06-05 12:14 am (UTC)(no subject)
From:no subject
Date: 2009-06-05 12:16 am (UTC)А как они заразились известно?
no subject
Date: 2009-06-05 12:20 am (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2009-06-05 01:06 am (UTC)no subject
Date: 2009-06-05 01:27 am (UTC)no subject
Date: 2009-06-06 03:21 am (UTC)no subject
Date: 2009-06-06 11:42 am (UTC)(no subject)
From:no subject
Date: 2010-07-14 07:31 pm (UTC)"Человек жил в соседстве с этими приматам довольно долго и конечно имел множество шансов подхватить этот (или похожий) вирус." - кто кого наделил - еще вопрос.
"Надо спрашивать не почему ВИЧ появился сейчас, а почему он не появился намного раньше? К сожалению, я ничего об этом не знаю и никаких исследований (и даже серьезных гипотез) не нашел." - не нашел никаких гипотез и не нашел серьезных гипотез - совсем разные парадигмы-с. я хоть и не искал ответа на тот вопрос, но и то нашел. у Ошо - "от медицины к медитации" - гл. СПИД.
no subject
Date: 2010-07-14 07:39 pm (UTC)Не только. Также и среди диких обезьян, у пум, у диких овец.
кто кого наделил - еще вопрос.
Это легко определяется путем филогенетического анализа.
К сожалению, я ничего об этом не знаю и никаких исследований (и даже серьезных гипотез) не нашел.
В принципе, есть вполне нормальная гипотеза о необходимости большого скопления людей для распространения ВИЧ. Будучи очень малозаразным вирусом (шансы на заражение при гетеросексуальном контакте меньше одного процента), ВИЧ требуется большое количество разных половых контактов в перемешивающейся популяции. Эта гипотеза подтверждается несколькими фактами, которые я конкретно сейчас перечислять не хочу, да, наверно, вам этого и не нужно.
(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2014-10-04 06:44 pm (UTC)no subject
Date: 2014-10-04 06:59 pm (UTC)no subject
Date: 2014-10-13 08:12 am (UTC)no subject
Date: 2014-10-13 11:11 am (UTC)Не половым путём, а через контакты жидкостей организма без присутствия воздуха, в том числе и через кровь!
(no subject)
From:no subject
Date: 2014-10-13 08:19 am (UTC)Убегаю...
no subject
Date: 2014-10-13 11:13 am (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2014-10-13 08:30 am (UTC)no subject
Date: 2014-10-13 10:47 am (UTC)no subject
Date: 2014-10-13 12:22 pm (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2014-10-13 11:09 am (UTC)Никогда не было таких исследований и такой терминалогии.
no subject
Date: 2014-10-13 12:24 pm (UTC)Поток средств изрядо иссяк однако, поэтому, вместо картин мирового апокалипсиса и массового вымирания обсасываются малоинтересные широкой общественности темы, как то - кода ВИЧ появился в человеческой популяции.
Ждём исследований на тему - почему ВИЧ не способен вызвать СПИД! :)
no subject
Date: 2014-10-13 12:27 pm (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2014-10-13 05:45 pm (UTC)no subject
Date: 2014-10-13 05:51 pm (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2014-10-14 07:57 am (UTC)no subject
Date: 2014-10-14 11:57 am (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2014-10-14 07:58 am (UTC)no subject
Date: 2017-06-24 02:13 pm (UTC)лучший коммент, ору.
Что такого интересного и необычного про вирусы?
Date: 2014-10-15 12:23 pm (UTC)Re: Что такого интересного и необычного про вирусы?
Date: 2014-10-15 01:04 pm (UTC)Re: Что такого интересного и необычного про вирусы?
From:Re: Что такого интересного и необычного про вирусы?
From:RE: Re: Что такого интересного и необычного про вирусы?
From:Re: Re: Что такого интересного и необычного про вирусы?
From:Re: Re: Что такого интересного и необычного про вирусы?
From:Re: Re: Что такого интересного и необычного про вирусы?
From:no subject
Date: 2014-10-15 02:19 pm (UTC)no subject
Date: 2014-10-16 02:54 pm (UTC)no subject
Date: 2014-10-19 06:47 pm (UTC)no subject
Date: 2014-10-19 07:04 pm (UTC)no subject
Date: 2014-11-26 12:09 am (UTC)По теме, промелькнула мысль, если бы вирус проявил себя несколько ( миллион ? ) лет раньше, то сейчас некому было бы писать об этом. )
no subject
Date: 2016-10-27 05:56 pm (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From: