![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
На каникулах с удовольствием прочитал раннего Гулда. Очень интересно и занимательно до сих пор, несмотря на то, что схема эволюции приматов, например, с тех пор изменилась. Из Гулда, с его эрудицией и умением писать популярно, вышел бы первоклассный ЖЖ-ист. Про книгу ничего больше добавить не могу, тем более что книжку оставил в одном из отелей, обменяв на Пратчета.
Зато при чтении ее мне вспомнился один интересный факт. Для объяснения того, почему он интересный, необходимо знать две вещи - что такое экзаптации и как "созревают" антитела в ответ на инфекцию. Если вам это неизвестно, то добро пожаловать под кат, а если известно, то кат можно и пропустить.
( Экзаптации и Антитела )
Вам, наверно, известно, что существуют антитела, обладающие широким спектром нейтрализации против ВИЧ. Они способны инактивировать самые разные варианты вируса. Антитела эти очень редкие и ученые очень интересуются процессами и механизмами, которые ведут к их появлению. Поскольку появление антител является эволюционным процессом, то для его исследования можно использовать стандартные эволюционные методы - секвенирование геномов и построение филогенетических деревьев, в которых существующие на данный момент формы выстраиваются по степени родства друг с другом. По этим деревьям можно восстановить генетические последовательности уже не существующих "предков". В данном случае этот процесс еще облегчается тем, что самый первый, изначальный предок, от которого все сегодняшние формы произошли, отлично известен - это ДНК, которая досталась нам от папы с мамой. Такой анализ был проделан для нескольких антител широкого действия, предки этих антител были установлены, искуственно синтезированы и тщательно изучены. И тут обнаружился очень интересный факт - эти ранние формы совершенно не связываются с ВИЧ! То есть на лицо процесс экзаптации. Изначально эти антитела появились в ответ не на ВИЧ, а на что-то иное (на что именно - мы не знаем), но потом некоторые из их потомков оказались способны связываться с ВИЧ и были отобраны для этой функции.
Что это означает для разработки вакцины? Много работы было проделано (и до сих пор делается) исходя из следущего подхода/гипотезы: Берем антитела широкого действия -> находим кусок вируса, с которым они связываются -> синтезируем этот кусок и используем его как вакцину -> получаем в вакцинированных людях антитела широкого действия, которые предотвращают инфекцию. Довольно быстро выяснилось, что подход этот не работает - куски вируса, с которыми связываются эти антитела, не вызывают при вакцинации появления антител широкого действия. Возможно, что дело тут именно в экзаптации - то есть вакцинировать надо сначала чем-то посторонним, чтобы появились антитела с потенциалом к превращению в антитела широкого действия, а потом уже проводить повторную вакцинацию с ВИЧ белками в надежде, что произойдет экзаптация.
Зато при чтении ее мне вспомнился один интересный факт. Для объяснения того, почему он интересный, необходимо знать две вещи - что такое экзаптации и как "созревают" антитела в ответ на инфекцию. Если вам это неизвестно, то добро пожаловать под кат, а если известно, то кат можно и пропустить.
( Экзаптации и Антитела )
Вам, наверно, известно, что существуют антитела, обладающие широким спектром нейтрализации против ВИЧ. Они способны инактивировать самые разные варианты вируса. Антитела эти очень редкие и ученые очень интересуются процессами и механизмами, которые ведут к их появлению. Поскольку появление антител является эволюционным процессом, то для его исследования можно использовать стандартные эволюционные методы - секвенирование геномов и построение филогенетических деревьев, в которых существующие на данный момент формы выстраиваются по степени родства друг с другом. По этим деревьям можно восстановить генетические последовательности уже не существующих "предков". В данном случае этот процесс еще облегчается тем, что самый первый, изначальный предок, от которого все сегодняшние формы произошли, отлично известен - это ДНК, которая досталась нам от папы с мамой. Такой анализ был проделан для нескольких антител широкого действия, предки этих антител были установлены, искуственно синтезированы и тщательно изучены. И тут обнаружился очень интересный факт - эти ранние формы совершенно не связываются с ВИЧ! То есть на лицо процесс экзаптации. Изначально эти антитела появились в ответ не на ВИЧ, а на что-то иное (на что именно - мы не знаем), но потом некоторые из их потомков оказались способны связываться с ВИЧ и были отобраны для этой функции.
Что это означает для разработки вакцины? Много работы было проделано (и до сих пор делается) исходя из следущего подхода/гипотезы: Берем антитела широкого действия -> находим кусок вируса, с которым они связываются -> синтезируем этот кусок и используем его как вакцину -> получаем в вакцинированных людях антитела широкого действия, которые предотвращают инфекцию. Довольно быстро выяснилось, что подход этот не работает - куски вируса, с которыми связываются эти антитела, не вызывают при вакцинации появления антител широкого действия. Возможно, что дело тут именно в экзаптации - то есть вакцинировать надо сначала чем-то посторонним, чтобы появились антитела с потенциалом к превращению в антитела широкого действия, а потом уже проводить повторную вакцинацию с ВИЧ белками в надежде, что произойдет экзаптация.
