shvarz: (Default)
[personal profile] shvarz
Все-таки интересный очень вирус. В большинстве случаев инфекция проходит за несколько дней с симптомами вроде мышечной и головной боли, температуры и усталости. Но в 1-2% случаев что-то происходит и человек "истекает кровью" - кровеносные капилляры становятся очень проницаемыми для молекул маленького размера и происходит массивная потеря плазмы крови, которая начинает из капилляров сочиться во все внутренние (и даже наружние) органы. При интенсивной терапии (возобновление жидкости и электролитов, снабжение дополнительным кислородом) человек часто выживает, но без нее - как правило умирает. Что именно ведет к такому исходу никто точно не знает и особенно загадочно то, что осложнения происходят не когда вирусная инфекция на пике, а когда иммунная система вроде-бы уже справилась с вирусом и начинает его подавлять. Наиболее общепринятой является теория, согласно которой осложнения происходят в результате чрезмерной активации иммунной системы, при которой одновременно выделяется слишком много цитокинов, но теория эта основана в большой степени просто на корреляции по времени начала проблем и наибольшего количества цитокинов в крови.

Еще одна загадка с Денге вирусами в том, что их есть четыре варианта и человек, однажды переболевший (даже в мягкой форме) одним из них, потом при инфекции другим с большей вероятностью получает осложнения. Опять же, есть общепринятая теория о наиболее вероятных причинах, но многие солгасны с тем, что у нее есть недостатки и объясняет она далеко не всё. Предположительно, виноваты тут антитела. Вирус Денге заражает клетки иммунной системы - макрофаги и дендритные клетки (о которых я недавно писал). И те и другие занимаются тем, что отлавливают и переваривают хлам, что появляется между клетками, но дендритные клетки преимущественно делают это для того, чтобы показать фрагменты этого хлама лимфоцитам, а макрофаги - просто чтобы избавить организм от потенциально вредных вещей. И те и другие, но особенно макрофаги, намного охотнее подбирают хлам, который покрыт антителами. И вот, предполагается, что первая инфекция вирусом Денге ведет к появлению антител, которые при последующей инфекции несколько отличающимся вариантом вируса, оказываются недостаточно эффективны, чтобы нейтрализовать его. Но при этом они связываются с вирусом, что увеличивает его вероятность быть подобраным макрофагом или дендритной клеткой, а значит и его способность их инфицировать.

В пользу этой теории говорит тот факт, что инфекция вирусом Денге протекает тяжелее у новорожденных, чем у более взрослых детей. Обычно бывает наоборот, потому что новорожденным достаются антитела от матери, которые помогают бороться с инфекцией, но которые через 4-8 месяцев исчезают. Тут же получается наоборот - эти антитела приносят лишь вред. Это же является одной из основных проблем в разработке вакцины - выработанные в ответ на нее антитела могут защищать от одного варианта вируса, но осложнять инфекцию другими тремя.

Date: 2011-10-12 07:42 am (UTC)
From: [identity profile] sergeyr.livejournal.com
> Все-таки интересный очень вирус.

Вы, эскулапы, страшные люди! Так и слышится за этой фразой что-то типа "ах, какая прелесть!"
B-)

Date: 2011-10-12 01:05 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Примерно так и есть :)

Date: 2011-10-13 08:28 am (UTC)
From: [identity profile] kotvaska16.livejournal.com
ну так и есть. это вообще не только у врачей, а у всех естественников.

Обычно бывает наоборот

Date: 2011-10-12 09:42 am (UTC)
From: [identity profile] demographer.livejournal.com
не понял
кривая смертности у младенцев исторически даже у дете до 5 и более лет, отличалась от всей остальной смертности направлением:
если для старших возрастов каждый прожитый период передвигает в следующий, где вероятность помереть выше, то у младенцев наоборот: наибольшая смертность в первый день/неделю/месяц/год

они, конечно, не токо от иммунных закидонов мрут

Re: Обычно бывает наоборот

Date: 2011-10-12 01:07 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Вы говорите о статистике сейчас или в прошлом, когда вакцин не было? И да, надо смотреть на конкретно смертность от инфекционной болезни.

и сейчас и в прошлом

Date: 2011-10-12 02:11 pm (UTC)
From: [identity profile] demographer.livejournal.com
населений, где от рождения смертность растёт всё-таки мало Япония или Исландия, и то, имхо, не с самого начала, но период этот сокращается

у младенцев на инфекцию малы выборки будут, имхо

Re: и сейчас и в прошлом

Date: 2011-10-12 03:10 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Вакцины перекашивают всю эту статистику. То, что первые несколько месяцев материнские антитела обладают защитным действием - хорошо установленный факт.

Кстати, вам наверно будет интересно: http://www.aidsmap.com/UK-Life-expectancy-on-HIV-treatment-improving-shows-importance-of-prompt-diagnosis-and-treatment/page/2101259/

спасибо

Date: 2011-10-12 03:43 pm (UTC)
From: [identity profile] demographer.livejournal.com
читал про это на бибиси :)
там покороче, тут дробнее

Date: 2011-10-12 02:37 pm (UTC)
From: [identity profile] tryptophobe.livejournal.com
Я год назад про него писал:
http://tryptophobe.livejournal.com/42782.html
http://tryptophobe.livejournal.com/43680.html

Ну и по поводу мышечной и головно боли, температуры и усталости - "Моя бывшая начальница встретила как-то американского военного, которому "посчастливилось" переболеть первой фазой. По его словам, "если бы я мог дотянуться до пистолета, я бы вышиб себе мозги". Высокая температура, боль в мышцах и суставах - слабые эпитеты для первой фазы."

Между прочим, антитела к белку NS1 вируса Денге вызывают ответ, похожий на аутоиммунный - они взаимодействуют с интегринами на эндотелиальный клетках, узнавая интегриновый RGD-мотив. Возможно, это одна из причин повышения проницаемости сосудов. И, кстати, Денге очень здорово меняет коагуляционные свойства крови в мышах (в частности, через PAF - platelet activating factor).

Date: 2011-10-12 02:49 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Спасибо. Я помнил, что где-то недавно читал, но найти не смог :) И, кстати, о "найти не смог" - мне кажется недавно мелькала статья, где иммунодоминантные районы из всех четырех серотипов были встроены в один белок, все перерыл - найти не могу. Очень элегантная работа с использованием структурной биологии.

Я так понимаю, что у симптомов очень большой градиент - у кого то очень мощные боли, а кто-то легче переносит.

Собственно запись спровоцирована очень неплохим обзором иммуннопатогенеза Денге, рекомендую: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0264410X11010437

Date: 2011-10-12 03:49 pm (UTC)
From: [identity profile] mindfie1d.livejournal.com
в недавнем выпуске Nat Rev Immunol есть обзор Ротмана, кажется там как раз цитируют работы с комбинированными белками разных серотипов.

http://www.nature.com/nri/journal/v11/n8/full/nri3014.html

Date: 2011-10-12 03:54 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Этот обзор я читал, но там как раз более традиционный подход описывается - смешать разные варианты вируса. Тут был один белок и химерность заключалась в переносе буквально нескольких аминокислот. Может у меня глюк и это было не про Денге, но там тоже было 4 исходных варианта.

(просительно)

Date: 2011-10-14 10:47 am (UTC)
From: [identity profile] sgustchalost.livejournal.com
а можете pdf обоих обзоров послать?
А то с меня денюшку требуют, а я жадный.

Re: (просительно)

Date: 2011-10-14 10:49 am (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
конечно. Кидайте емейл в личку или на имя.фамилия в гмейле.

Как и у всех флави

Date: 2011-10-13 04:38 pm (UTC)
From: [identity profile] sgustchalost.livejournal.com
90-98% инфекций вообще проходят бессимптомно.
Серопозитивны от 20% до 90% взрослых, а болеют много меньше.

Re: Как и у всех флави

Date: 2011-10-13 05:57 pm (UTC)
From: [identity profile] tryptophobe.livejournal.com
По CDC - 50-100 млн инфекций (как я понимаю, включая и бессимптомные), 50000 случаев лихорадки, 22000 смертей в год.
http://www.cdc.gov/dengue/epidemiology/index.html.

Re: Как и у всех флави

Date: 2011-10-14 09:22 am (UTC)
From: [identity profile] sgustchalost.livejournal.com
Today about 2.5 billion people, or 40% of the world’s population, live in areas where there is a risk of dengue transmission see WHO/Impact of Dengue. Dengue is endemic in at least 100 countries in Asia, the Pacific, the Americas, Africa, and the Caribbean. The World Health Organization (WHO) estimates that 50 to 100 million infections occur yearly
(оценка, включая бессимптомные. Около 1 млн в год - официальная регистрация)
, including 500,000 DHF cases (оценка, тяжелые, требуют госпитализации обычно; я бы предположил около 5 млн включая легие формы, без госпитализации)
and 22,000 deaths, mostly among children.
(оценка, Около 2000 в год - официальная регистрация)


Re: Как и у всех флави

Date: 2011-10-14 01:29 pm (UTC)
From: [identity profile] tryptophobe.livejournal.com
А откуда официальные данные по регистрации?
Уровень Денге в Таиланде колеблется значительно от публикации к публикации, но получается от примерно 6/10000 (http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969710008570) до 24/1000 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3066139/?tool=pubmed), что, при населении Таиланда в 65 млн человек, дает от 39 тыс до 1/5 млн лабораторно подтвержденных случаев. Смертность в 2000 в год кажется мне заниженной, поскольку только за одну вспышку в Индонезии в 2004 году умерло 450 человек (это не окончательная оценка, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0140673604158297). Ну и до кучи - multiplication factors, разные для разных возрастных групп.

Официальные данные ВОЗ

Date: 2011-10-14 01:55 pm (UTC)
From: [identity profile] sgustchalost.livejournal.com
берутся из официально присланных официальных (не обязательно лабораторно подтвержденных) данных, присланных странами. Менять их нельзя. Обычно они серьезно занижены.
А вот на оценках ВОЗовцы оттягиваются по полной. Я ситуацию по денге знаю плохо, но, зная ВОЗовцев, верил бы в половину их оценок, то есть 30 million infections occur yearly (включая бессимптомные) и 10,000 deaths, mostly among children.

А разве

Date: 2011-10-13 04:36 pm (UTC)
From: [identity profile] sgustchalost.livejournal.com
RGD-мотив не на белке оболочки?
У большинства других флави комплекса япон энцефалита - точно на на белке Е.

Re: А разве

Date: 2011-10-13 05:54 pm (UTC)
From: [identity profile] tryptophobe.livejournal.com
Ну, я вообще говорил про антитела к белку NS1, которые узнают RGD-мотив на интегринах эндотелиальных клеток в культуре. Как раз это пытались привязать к увеличению проницаемости сосудов при инфекции вирусом Денге.
Вообще, NS1 может играть очень важную роль в иммунопатогенезе Денге (который не относится к группе японского энцефалита).
У клещевого антитела к NS1 в определенных условиях протективны на мышах.
Насчет японского - не смотрел.

вечером разумом ослаб.

Date: 2011-10-14 09:37 am (UTC)
From: [identity profile] sgustchalost.livejournal.com
"Денге (который не относится к группе японского энцефалита)" - бессолзнательно имел в виду "комариные" флави по контрасту с клещевыми.

"У большинства других флави комплекса япон энцефалита - точно на на белке Е."
Вовсе нет. У яп. энцеф - да, RGD-мотив на белке оболочки.
У западного Нила - в основном RGЕ на белке оболочки, RGD нигде нет.
У Сент-Луис - в основном RGТ на белке оболочки, RGD нигде нет.
(а у клещ энцефалита VGE на белке оболочки).
Денге смотреть лень.

NS1 важен (неясно как), но вощем-то все белки важны, особенно Е и NS3.

Re: вечером разумом ослаб.

Date: 2011-10-14 01:42 pm (UTC)
From: [identity profile] tryptophobe.livejournal.com
Мотивы на белках оболочки - а какую роль они там играют? Я подозреваю, что подобные мотивы можно найти в массе белков, если порыть через BLAST, однако это не указывает на их родство с интегринами.
"Особенно Е и NS3" - ну, это смотря для чего. Для репликации наличие белка Е неважно, зато С-концевой, по-моему, фрагмент "гена" белка С необходим для успешной репликации.
Что касается иммунопатогенеза - NS2, NS4b иNS5 играют принципиальную роль в продолении врожденного ответа через интерфероны, NS3 делает что-то с 2',5'-OAS.
"NS1 важен (неясно как)" - NS1 модулирует активность комплемента и cell targeting.
Для создания вакцины - наверное, E и NS1, хотя для клещевого Эльберт с коллегами показали, что концентрированный антиген Е не дает достаточно сероконверсии и протективности. Другая ситуация - если вставить его в плазмиду и иммунизировать ей мышей (см. работы Тимофеева А.В.)

Re: вечером разумом ослаб.

Date: 2011-10-14 02:04 pm (UTC)
From: [identity profile] sgustchalost.livejournal.com
"Мотивы на белках оболочки - а какую роль они там играют?" - Это, как минимум, запасной сайт связывания с клетками хозяина, а иногда и основной. До конца неизвестно, спорят.

"фрагмент "гена" белка С необходим для успешной репликации. Что касается иммунопатогенеза - NS2, NS4b иNS5 играют принципиальную роль в продолении врожденного ответа через интерфероны, NS3 делает что-то с 2',5'-OAS. NS1 модулирует активность комплемента и cell targeting."
Я лучше эту теманику знаю для вируса Западного Нила, хотя похоже в грядущем году придется и в денге разбираться (Егор, спасибо за статьи, очень вовремя).
Для ВЗН публикации в таком духе много, вплоть до Нейчур, но наблюдения за ними в течении 10 лет покзывают, что касаются они частных моментов, а консенсусной и достаточно полной картины связи генов ВЗН (и их геновариантов) с патогенозом ЛЗН пока не складывается.
Про денге - профессионально через год.

Re: вечером разумом ослаб.

Date: 2011-10-14 03:10 pm (UTC)
From: [identity profile] tryptophobe.livejournal.com
Я не нашел статей, указывающих на основную роль RGD вв белке Е вируса долины Мюррея в связывании с клеткой (есть две статьи, предполагающие подобную роль, но указывающие на ее непринципиальность). Флавивирусы связываются через глюкозаминогликаны, если мне не изменяет память.
"Частные моменты" за последние 10 лет позволили достаточно полно охарактеризовать белки, ответственные за преодоление врожденного иммунитета вирусом Денге, которые я и перечислил. Хромых, Ши и Даймонд довольно полно охарактеризовали ВЗН, насколько я помню.

Re: вечером разумом ослаб.

Date: 2011-10-14 04:39 pm (UTC)
From: [identity profile] sgustchalost.livejournal.com
"основную роль RGD вв белке Е вируса долины Мюррея в связывании с клеткой (есть две статьи, предполагающие подобную роль, но указывающие на ее непринципиальность). Флавивирусы связываются через глюкозаминогликаны, если мне не изменяет память."

Те, кто этим занимается плотно, еще не доругались.

[18] Chu JJ, Ng ML. Interaction of West Nile virus with alpha v beta 3 integrin mediates virus entry into cells. J Biol Chem 2004; 279(52): 54533-41.
[19] Dai J, Wang P, Bai F, Town T, Fikrig E. ICAM-1 participates in the entry of West Nile virus into the central nervous system. J Virol 2008; 82(8): 4164-8.
[20] Davis CW, Nguyen HY, Hanna SL, Sanchez MD, Doms RW, Pierson TC. West Nile virus discriminates between DC-SIGN and DC-SIGNR for cellular attachment and infection. J Virol 2006; 80(3): 1290-301.
[21] Bogachek MV, Protopopova EV, Loktev VB, et al. Immunochemical and single molecule force spectroscopy studies of specific interaction between the laminin binding protein and the West Nile virus surface glycoprotein E domain II. J Mol Recognit 2008; 21(1): 55-62.
[22] Chu JJ, Leong PW, Ng ML. Analysis of the endocytic pathway mediating the infectious entry of mosquito-borne flavivirus West Nile into Aedes albopictus mosquito (C6/36) cells. Virology 2006; 349(2): 463-75.

"касаются они частных моментов, а консенсусной и достаточно полной картины связи генов ВЗН (и их геновариантов) с патогенозом ЛЗН"
Вот только один пример:
Brault AC, Huang CY, Langevin SA, et al. A single positively selected West Nile viral mutation confers increased virogenesis in American crows. Nat Genet 2007; 39(9): 1162-6.
Ага, а европейским воронам (и людям) плювать на эту мутацию.

Вот миленькая статья, но почему-то развития не получила.
Krishnan MN, Ng A, Sukumaran B, et al. RNA interference screen for human genes associated with West Nile virus infection. Nature 2008; 455(7210): 242-5.

Re: вечером разумом ослаб.

Date: 2011-10-14 05:00 pm (UTC)
From: [identity profile] tryptophobe.livejournal.com
Насколько я понял, речь в этих статьях идет не о RGD-мотиве в белке Е, а о роли интегринов в адгезии и входе вируса в клетку и способности RGD-пептида блокировать эти взаимодействия. DC-SIGN и L-SIGN рассматриваются как возможные, но не единственные. Про RGD-мотив в белке Е я ничего найти не смог толком.

Date: 2011-10-18 11:20 pm (UTC)
From: [identity profile] inmigrante.livejournal.com
Приятненько.... С изменением климата она все быстрее по Европе распространяется. Брррр....

March 2022

S M T W T F S
  12345
6789101112
13141516171819
20212223242526
2728293031  

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Feb. 26th, 2026 02:04 am
Powered by Dreamwidth Studios