shvarz: (Default)
[personal profile] shvarz
тут
Полный текст под катом для тех, кому интересно

Roche is shuttering its 454 Life Sciences sequencing operations and layingoff about 100 employees, the company confirmed today.

The 454 sequencers will be phased out in mid-2016, and the 454 facility inBranford, Conn., will be closed "accordingly," Roche said in astatement e-mailed to GenomeWeb Daily News.

The 100 layoffs will take place during the next three years, and,"Roche is committed to finding socially responsible solutions for theemployees affected by these changes," it added.

Until the business is shut down, Roche will provide service and support to454 instruments, parts, reagents, and consumables.

"Sequencing is a fast-evolving technology," the firm said."With the continuous efforts of the sequencing unit in building a diversepipeline of potentially differentiated sequencing technologies, Roche iscommitted to introducing differentiated and competitive products to the marketand offer[ing] a sequencing product pipeline for both life science and clinicalapplications."

Roche <ahref="http://www.genomeweb.com/sequencing/roche-acquire-454-155m-plans-use-sequencer-ivd-applications">bought454 from Curagen in 2007 for $155 million in cash and stock, saying at thetime the deal would solidify its access to future 454 sequencers and enable itto use the tools for in vitro diagnostic applications. Prior to thepurchase, Roche had been 454's exclusive distributor starting in 2005.

Roche does not break out revenue figures for the 454 business, but in recentyears, with the ascent of other sequencing technologies, the 454 instrumentswere pushed to the research margins. More recently, lower-throughput sequencerssuch as Illumina's MiSeq and Life Technologies' Ion Torrent systems havefurther moved the 454 technology toward irrelevance.

Over the past few years, Roche has made efforts to stay involved with thenext wave of sequencing technologies in development. It forged alliances with <ahref="http://www.genomeweb.com/dxpgx/roche-ibm-co-developing-nanopore-based-dna-sequencing-technology">IBMand <ahref="http://www.genomeweb.com/sequencing/roche-dna-electronics-partner-semiconductor-based-sequencing">DNAElectronics in 2010, and in early 2012 it made a <ahref="http://www.genomeweb.com/sequencing/roche-announces-57-billion-hostile-takeover-bid-illumina">hostilebid for Illumina that eventually reached a price tag of $6.7 billion — abid that was rejected by Illumina.

After being rebuffed by Illumina, Roche continued trying to resuscitate itssequencing operations, and in December 2012, <ahref="http://www.genomeweb.com/sequencing/illumina-stock-gains-amid-report-new-bid-roche">reportssurfaced that Roche was again courting Illumina, though no dealmaterialized.

Then, earlier this year, Roche announced it had ended its deals with IBM andDNA Electronics, and said simultaneously it would <ahref="http://www.genomeweb.com/sequencing/roche-shut-down-applied-sciences-business-area-cut-jobs-germany-and-connecticut">shutdown its R&D efforts in semiconductor sequencing and nanoporesequencing, resulting in about 60 layoffs at the Branford site.

The company said at the time that it was <ahref="http://www.genomeweb.com/sequencing/roche-shut-down-applied-sciences-business-area-cut-jobs-germany-and-connecticut"target="_blank">consolidating its 454 and NimbleGen products into a newsequencing unit covering both life science and clinical diagnosticapplications. Dan Zabrowski, head of Roche Applied Science, who was to head thenew sequencing unit, told In Sequence then, "We are fullycommitted to [our] life science business, and this decision did not have animpact on any of our businesses or customers. We continue to think thatsequencing is going to play an important role in life science and in theclinic."

Roche is not abandoning the sequencing space entirely, though. Last monththe firm <ahref="http://www.genomeweb.com/sequencing/roche-pacbio-develop-ngs-based-clinical-dx-potential-75m-deal">forgeda deal for up to $75 million with Pacific Biosciences to develop diagnosticproducts based on PacBio's SMRT technology.

"Roche sees great potential in this sequencing technology which offersunprecedented read length, accuracy, and speed for the development of futuresequencing based applications in clinical diagnostics," Roche said. 




Лет десять назад они были пионерами с принципиально-новой технологией, с тех пор побывали в лидерах, а сейчас вот уже закрываются не выдержав конкуренции. Как все быстро происходит.

Date: 2013-10-15 09:27 pm (UTC)
From: [identity profile] vigna.livejournal.com
Давно пора. С некоторым злорадством жду закрытия ещё одного детища Ротберга.

Date: 2013-10-16 12:16 am (UTC)
From: [identity profile] bret.livejournal.com
ну, Ротберг-то при этом свои сливки с каждого детища получает по полной, прежде чем перейти к другому.

Date: 2013-10-16 12:27 am (UTC)
From: [identity profile] vigna.livejournal.com
Это-то понятно. Я вообще против Ротберга ничего не имею, меня просто раздражает чересчур агрессивная реклама ионов.

Date: 2013-10-17 09:12 am (UTC)
From: [identity profile] vigna.livejournal.com
Да понятно. Но у них пока с обещаниями лучше, чем со свершениями.
Вообще, если рационально, то я за всяческое развитие ионов - а то иллюмина в отсутствие конкуренции совсем разболталась - цены повысили, контроль качества снизили...

Date: 2013-10-17 05:47 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
я очень надеюсь, что ихнее время прошло, и тех и других. а мы скоро увидим какую-нибудь реально работающую технологию безамплификационного секвинирования

Date: 2013-10-15 09:50 pm (UTC)
From: [identity profile] topol2009.livejournal.com
Ну главная причина в том, что в 2015 году Рош планирует представить свой полупроводниковый секвенатор новый. Так что об утрате лидерства я бы повременил говорить - такие конторы не сдаются.
Ну и иллумину ждет в скором будущем то же самое - все самое вкусное из флуоресцентной технологии уже выжали, пока они лидеры, но это только пока.

Date: 2013-10-15 10:09 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
В процитированной статье пишут, что полупроводниковую программу они еще раньше закрыли.

Date: 2013-10-16 09:36 pm (UTC)
From: [identity profile] topol2009.livejournal.com
Это они про конкретную фирму. А в целом Рош в стороне не останется в любом случае - слишком лакомый кусок для фармы - клиника в общем-то ждет только снижения цены и упрощения workflow, потребность есть уже довольно серьезная.

Date: 2013-10-15 11:46 pm (UTC)
From: [identity profile] agasfer.livejournal.com
А в конкуренции ли дело? Может, спрос упал?

Date: 2013-10-16 09:46 am (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
На секвинирование? Больше чем когда либо.

Date: 2013-10-16 12:11 pm (UTC)
From: [identity profile] agasfer.livejournal.com
А за счет чего? Бюджет NIH достиг пика в 2010, после чего снизился и в 2013 он равен бюджету 2007, без учета инфляции (c поправкой уменьшаем в 1.1 раза доллара 2012:2007). Биг фармы? Частные заведения вроде Ховард Хьюза?

Date: 2013-10-16 01:27 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
За счет перераспределения в бюджетах финансирующих организаций. Ну и фарма-биотех тоже подтягиваются.

Date: 2013-10-16 01:31 pm (UTC)
From: [identity profile] agasfer.livejournal.com
Биотех в глубокой жопе, а большие фармы склонны геномику делать сами, из-за присущей им паранойи секретности вокруг перспективных исследований. Кто-нибудь делал независимые маркетнг исследования. вы не в курсе?

Date: 2013-10-16 01:33 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Нет, таких деталей я не знаю.

Date: 2013-10-16 01:41 pm (UTC)
From: [identity profile] agasfer.livejournal.com
Сколько я помню, медицинские дискуссии свелись к "а нафик нам этот сиквенс, если мы не знаем, что с результатами делать? Слишком много информации, которую нам лучше бы не знать!" Т е сиквенс врачам дает этическую дилемму, что делать с "избыточной" информацией? Врач ведь привык, что пациент жалуется конкретно на прыщик или на понос--вот он от них и лечит. А что делать с "да у вас голубчик склонность к инфаркту!" при жалобах на прыщик доктор не знает.

Date: 2013-10-16 01:43 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Медицинские - да, но в науке то нашли кучу применений.

Date: 2013-10-16 01:47 pm (UTC)
From: [identity profile] agasfer.livejournal.com
Вот только финансирование науки упало. Плюс, даже те гранты, которые удается получить, до науки не доходят. Мне проф из У-та МД жаловался год назад, что у них администрация уже 40% отстегивает, а начале нулевых только 10% шло на оверхед. А вы что имели ввиду под "перераспределением"?

Date: 2013-10-16 01:57 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Что-то мне очень сомнительно, что десять лет назад оверхеды были 10%, а 40% это еще очень по-божески (можно даже сказать нереально мало). Что-то у вашего профа цифры не сходятся.

Перераспределение в том, что во многих местах, где раньше использовалось обычное секвенирование (или там microarray), сейчас делают NGS. Ну и в том, что раньше может вообще не секвинировали, а сейчас секвинируют. По общим тенденциям финансирования такие вещи не отследишь.

Date: 2013-10-16 02:01 pm (UTC)
From: [identity profile] agasfer.livejournal.com
Ну я проверить не могу, за что купил, за то и продал.

2е можно свести к "технический прогресс повысил производительность труда". Слишком много стало сиквенаторов--как фермеров в конце 1920х.

Date: 2013-10-16 02:06 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Так всегда с новыми технологиями, на них мода появляется и все пытаются их к своим задачам как-нибудь присобачить.

У меня может личный перекос, но в нашей области NGS очень к месту пришелся, у ВИЧ каждый третий потомок несет мутацию, обычным секвинированием их задолбаешься вылавливать. Плюс сейчас вот еще отслеживают репертуар B-клеток и созревание антител, тоже обычным секвенированием их не возьмешь.

Date: 2013-10-16 02:11 pm (UTC)
From: [identity profile] agasfer.livejournal.com
Да канешн, не спорю. Вы в академии, простите за любопытство?

Date: 2013-10-16 02:13 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
В некотором роде, но не у станка уже.

Date: 2013-10-16 02:21 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
У нас основное финансирование от Гейтса, поэтому пока ттт все ок, но как и у всех, на будущее загадывать невозможно.

Date: 2013-10-16 02:26 pm (UTC)
From: [identity profile] agasfer.livejournal.com
О, Гейтс! "Халява, сэр!" Рад за вас. Мне к сож надо ехать по делам, но хочу поблагодарить за беседу и очень важные сведенья, которые мне, как путешественнику, чрезвычайно интересны :)

Date: 2013-10-16 05:21 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
это как считать. сейчас секвинируют больше проб, конечно. но и работающих инструментов больше и производительность у них возросла во многие разы. очередей на секвинирование практически нет

Date: 2013-10-16 05:27 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Ну это как раз говорит о том, что виновата именно конкуренция. Если бы были очереди, то может 454 и выжили бы.

Date: 2013-10-16 05:56 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
я только про спрос. проиграл 454 конечно конкурентам и не сейчас: долгие годы по чуть-чуть проигрывал. если бы у них сейчас был хороший процент пользователей, то их бы сервис и реактивы кормили

Date: 2013-10-16 06:17 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Ну так и спрос тоже однозначено вырос, просто предложение опережает.

Date: 2013-10-16 07:53 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
[я тоже словами жонглировать умею] спрос на новые приборы упал, потому что расширение сервиса мало кого интересует

Date: 2013-10-16 01:56 am (UTC)
From: [identity profile] elena-lenalena.livejournal.com
Мне кажется, что в упадке крупнейших биотехнологических компаний виноват перекос в кадровой политике, когда даже на уровне среднего руководства идет вымывание специалистов (инжинеров и биохимиков) и замещение их болтунами с MBA.

Они руководят технологическими процессами и разроботкой, а сами часто практически всегда несут такую чушь, но приходися это исполнять.

Date: 2013-10-16 04:37 pm (UTC)
From: (Anonymous)
И ещё не хватает рекламы/информации о "конечных продуктах/услугах" для потребителей, т.е. всё равно в итоге все приходят к необходимости самоокупаемости разработок.

Date: 2013-10-16 07:37 am (UTC)
From: [identity profile] nu-sha.livejournal.com
ага, впечатляюще быстро

Date: 2013-10-16 09:26 am (UTC)
From: [identity profile] 2myshki.livejournal.com
в целом это было ожидаемо, на 454 работали только по инерции. весь спектр задач сейчас гораздо лучше закрывается йонторрентом и иллюминой. точнее наоборот ;)

Date: 2013-10-16 07:06 pm (UTC)
From: [identity profile] genseq (from livejournal.com)
Недавно вышел обзор о перспективах развития полупроводниковой технологии секвенирования:
Секвенирование по Ротбергу (потенциал полупроводникового секвенирования)
http://biomics.ru/nomera/2013/56-sekvenirovanie-po-rotbergu-potencial-poluprovodnikovogo-sekvenirovaniya.html

Там довольно подробно разбирается и уже официально "усопшее" пиросеквенирование.

Ротберга прошу не обижать. Именно ему мы обязаны прорывом в этой области и появлением NGS. Если бы умер, то ему бы уже памятник поставили. К счастью, он ещё живой.

March 2022

S M T W T F S
  12345
6789101112
13141516171819
20212223242526
2728293031  

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Feb. 24th, 2026 09:42 am
Powered by Dreamwidth Studios