Модель вируса гриппа

[shvarz]

Ребята из VisualScience продолжают радовать отличными моделями вирусов. В этот раз вирус гриппа:

Comments

[-hog-.livejournal.com]

первая мысль была - вязание какое-то... рукодельния творенье =)

[shultz-flory.livejournal.com]

То же.

[kotvaska16.livejournal.com]

Красивый:)
А вид от типа вируса зависит?

[shvarz.livejournal.com]

Только мелкие детали должны меняться. Общий вид должен быть таким же.

[kotvaska16.livejournal.com]

Спасибо, я пока в относительных размерах не очень.

[shvarz.livejournal.com]

Ну, в этой модели взяты какие-то конкретные структуры белков, а вирус мутирует постоянно. Мутации в вирусных белках должны вести к некоторым изменениям, но это будут небольшие изменения в формах белков. Обычно общая структура остается неизменной, меняются всякие петли.

[kotvaska16.livejournal.com]

Спасибо большое за ответ:)

[ango.livejournal.com]

хорош)

[cu.livejournal.com]

Ребята, которые делали такую картинку с ВИЧ, если мне не изменяет память, просто распечатали модель на 3D-принтере и фотографировали. А это, похоже, рендер. Красиво.

[shvarz.livejournal.com]

Это те же самые ребята и нет, сначала была компьютерная модель, а потом уже попытки напечатать ее на 3D принтере. К сожалению, не очень удачные, потому что мелкие детали вируса делают пластиковую модель очень хрупкой. У меня такая модель дома стоит, у нее пара белков оболочки уже отломилась.

[alcedorussicus.livejournal.com]

Не только красиво, но и полезно.Текст про вирус гепатита дельта перевожу. С такими картинками проще и приятнее работать над переводом.

[invicturum.livejournal.com]

какой то он шерстяной-вязазаный, ахаха

[lemon2018.livejournal.com]

рецепторы! три ножки цепляются за cd4+ и три подножки цепляются за корецептор ссr5 или схсr4

[tatiana-sofr.livejournal.com]

Какой он сложный!

[polenadisto.livejournal.com]

Вирус гриппа по-своему прекрасен, если это слово считать применимым к вирусам)
До сих пор вспоминаю "контрольный" вопрос с биофаковского зачета по вирусологии: "А чем интересен вирус гриппа?"

[shvarz.livejournal.com]

А чем он не интересен?

[polenadisto.livejournal.com]

Вот этот вопрос мог бы поставить меня в тупик! Но я, к счастью, понял, что экзаменатор имеет в виду тот факт, что у него геном состоит из восьми (если память не изменяет) отдельных фрагментов.

[misha-b.livejournal.com]

А насколько точна такая визуальная модель? Выглядит очень красиво.

[shvarz.livejournal.com]

В чем измерить точность? Структуры белков известны, их роль в вирионе - тоже, примерное соотношение количества - тоже. Детали их расположения - это в основном фантазия, тем более что от вириона к вириону они будут отличаться.

[overscience-mes.livejournal.com]

потрясающе!

[my-virtual.livejournal.com]

Хочется пустить по ней игрушечный паровозик.

[vasja-iz-aa.livejournal.com]

А внутри реального вируса бывают включения РНК или белков хозяйской клетки, случайно захваченые?

[shvarz.livejournal.com]

Если вирус с жестко-определенной структурой (обычно маленькие вирусы), то нет. Если же "мешок с барахлом" вроде ВИЧ или гриппа, то да, там бывают много и часто.

[vasja-iz-aa.livejournal.com]

может это надо отражать в подобных моделях? что б они более жизненные были

а как много они захватывают? есть какие-нибудь работы по тому, сколько и какой РНК ВИЧ в себя может набрать, я б почитал с большим интересом

[shvarz.livejournal.com]

В модели ВИЧ они отражены, пусть не все, но наиболее часто встречающиеся. Это во многом случайный процесс, но некоторые белки играют роль в жизненном цикле. Из РНК, в ВИЧ попадают tRNAs, это частично случайный процесс, а частично вирус их специально подбирают - одна из них служит праймером для инициации обратной транскрипции. Мне кажется никто особо подробно этот процесс не изучал. Про ВИЧ и белки вот есть обзорная статья, немного устаревшая: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18265424

[vasja-iz-aa.livejournal.com]

спасибо, я почитаю

[affidavid.livejournal.com]

Выглядит забавно, но эта мелкая текстура имеет очень малое отношение к реальности. Такие модели дают иллюзию того, что струкура известна во всех деталях, что очень далеко от истины.

[shvarz.livejournal.com]

Мелкая текстура - как раз имеет очень большое отношение к реальности. Фантазии скорее в том, как именно белки друг относительно друга располагаются. Но идея в том, что в этой модели этой фантазия ограничена тем, что мы действительно знаем.

[affidavid.livejournal.com]

В этой мелкой текстуре присутствуют ненужные рюшечки в виде отдельных молекул липидов и отсутствуют очень важные вещи типа катионов металлов, связанных с РНК, куча других вещей. Просто очень многие люди воспринимают компютерные картинки не как работу художника по мотивам реальных данных, а как типа фотографию настоящего вируса. Потом разоблачение допущенных неточностей составляет питательную среду для ВИЧ дениалистов и прочей публики.

[shvarz.livejournal.com]

Ммм, сомневаюсь, что это действительно распространенная проблема. Покажите мне ВИЧ-дениалиста, который стал дениалистом потому что на подобной модели не видно катионов металлов. Опять же, непонятно что вы предлагаете - не строить моделей? Рисовать пару кружочков в powerpoint-е?

[affidavid.livejournal.com]

Да, имеено рисуночнки в powerpoint. Потому как эти рисуночки отражает и то, что мы знаем, и то, что мы не знаем. Роскошная компьютерная графика на дает понятия о том, что мы еще не знаем, и заменяет это на фантазии.

[shvarz.livejournal.com]

Каким образом рисуночки в poweproint дают представление о том, что мы знаем? Там мощный перекос в противоположную сторону. Возьмите рисунок из википедии: http://en.wikipedia.org/wiki/File:3D_Influenza_virus.png
Мы действительно не знаем ничего о HA, кроме того, что он выглядит как пирамидка? И про геном мы знаем, только что это RNP?

[lemon2018.livejournal.com]

В белке интегразы есть ион цинка.