Со СПИДом (опять) не покончено

[shvarz]

Уже третий человек просит прокоментировать новость вроде этой.
Новость эта основана вот на этой статье (к сожалению paywall) и, как водится, даже там где журналисты не переврали в тексте, редакторы все испохабили заголовком. Со СПИДом, конечно, ни фига не покончено, хотя статья довольно интересная.

Как известно, одна из основных проблем с ВИЧ в том, что вирус встраивает свою ДНК в геном клетки хозяина и в таком виде может существовать очень долго. Одно время считалось, что если уж он туда встроился, то вырезать его потом оттуда уже невозможно. Однако за последние лет 10 примерно в живом мире были найдены три-четыре системы, которые умеют резать ДНК с удивительной специфичностью. И что важно - устроены они так, что в принципе не так уж сложно перенастроить их на любую интересующую вас последовательность ДНК. Краткий обзор этих систем можно прочитать на биомолекуле в статье "А не замахнуться ли нам на... изменение генома".

И народ сразу оживился и стал пытаться использовать эти системы для того, чтобы бороться с ВИЧ. Пара из таких подходов сейчас уже проходят клинические испытания, а в этой статье был описан еще один.

Собственно, самое интересное в этой статье, это та система, которую они решили использовать. Называется она CRISPR и в бактериях отвечает по сути дела за "приобретенный иммунитет" к бактериофагам. Она потрясающе интересно устроена и я все хочу про нее написать, но как следует это сделать все не доходят руки, а на "кое как" такую хорошую тему изводить жалко.

Но для понимания этой статьи достаточно знать лишь то, что там есть специальный белок и есть специальная РНК, которую можно изменить так, что этот белок будет резать любую выбранную вами последовательность нуклеотидов из примерно 20 оснований. Авторы натравили этот белок на очень консервативные части генома ВИЧ и показали, что в клеточных культурах это дело отлично работает. Геном ВИЧ режет, клеточную ДНК не трогает. Причем ВИЧ режет как уже встроившийся, так и новый - поэтому клетки получаются устойчивые к ВИЧ.

Проблема с этим методом (как и со многими другими разными хитрыми методами) заключается как всегда в доставке. В клеточной культуре мы имеем способы доставить нужные белки и РНК в 99% клеток, а вот в организме человека с этим проблема. Нет пока хороших способов эффективно, специфично, и безопасно доставить нужные гены в нужные клетки. Над этим, естественно, работают. Делают разные вирусные векторы, наночастицы и т.п. Но до практики пока очень далеко.

Comments

[mitrichu.livejournal.com]

Можно вопрос?
Вод СПИД - это вроде инфекция. которую можно, но не очень скоро победить.
А что далее?
Что далее нас ждёт?
Об этом думают, либо пока не кукарекает петух, мы спим?

[shvarz.livejournal.com]

Не совсем понимаю вопрос, он подразумевает, что кто-то ждет того, чтобы победить СПИД прежде чем заниматься другими болезнями. Но это не так, параллельно занимаются самыми разными инфекциями.

[mitrichu.livejournal.com]

Извините за дурацкий вопрос. я имел ввиду. что СПИД - это только начало. Как Вы думаете. что нас мождет ждать ещё?

[stetzen.livejournal.com]

Я правильно понимаю, что для того, чтобы эта штука сработала, нужно сначала снизить вирусную нагрузку фактически до нуля и держать в таком виде довольно долго? Иначе же будет бег наперегонки - вирус будет заражать новые клетки, эта штука будет его из них вычищать, и в итоге человек будет на ней сидеть вечно, а она, кмк, будет и менее эффективна, чем нынешние антиретровирусные, и дороже. То есть оно по идее работать должно на самом последнем этапе.

[shvarz.livejournal.com]

Смотря как ее доставить. Если ее суметь закинуть в большинство CD4 клеток, то можно и без терапии.

[bolshenerusskiy.livejournal.com]

В чем разница между клеточной культурой и живым человеком в плане заражения клеток резательными белками и РНК?

[myhiv.livejournal.com]

Спасибо, как всегда, за разъяснение ситуации. А то люди обращаются с вопросами, т.к. начитались журналистских изысков, а моей квалификации явно недостаточно чтобы читать оригинал статьи и выяснять, где правда, а где фантазии журналистов.

[shvarz.livejournal.com]

Если похоже на то, что новость на основе какой-то реальной работы, то кидайте мне, я с удовольствием прочитаю оригинал.

[myhiv.livejournal.com]

Спасибо, Егор, так и буду делать!

[frold.livejournal.com]

"устроены они так, что в принципе не так уж сложно перенастроить их на любую интересующую вас последовательность ДНК. "
Получается что рост раковых клеток тоже можно так рубить?

[misha-makferson.livejournal.com]

А разве раковые заболевания вызываются встраиванием чужеродной ДНК? Или что вырезать то?

[shvarz.livejournal.com]

Иногда можно определить конкретные соматические мутации, отвечающие за рак. В таких случаях в принципе можно себе представить ситуацию, когда раковые клетки сначала секвенируют, чтобы найти такие мутации, а потом фигачат этой системой. Но это еще дальше в будущем, чем анти-СПИДовые применения.

[Илья Цыгвинцев (from livejournal.com)]

http://shvarz.livejournal.com/224095.html

[shvarz.livejournal.com]

Лично мной не любим. Потому как он никогда честно не скажет, где именно его мнение совпадает с большинством, где он начинает уходить в сторону, а где он полностью фантазирует. Если бы говорил, то в принципе интересно было бы кое-что читать.

[asena.livejournal.com]

Мы в "Здоровье" написали об этом более сдержанно, но в целом и статья по ссылке кажется мне не то чтобы плохой и вредной. Ну да, редакторский заголовок жжет. Ну да, формулировка "удалить из клеток организма" вводит в заблуждение. Но все равно же они в тексте оговаривают, что это "шаг на пути" и что на доработку методики потребуется время.
А в целом, мне кажется, главная функция вот такой вот первой ступени популяризации, новостей для широкой публики, в общем-то не в том, чтобы объяснить, как все устроено, а в том, чтобы создать эмоциональное ощущение "наука делает крутые вещи и приносит кучу пользы". Это довольно важно, формировать такое ощущение, мне кажется, и с этой точки зрения я понимаю и использование чрезмерно оптимистичных формулировок (хотя обычно и пресекаю его в деятельности своих авторов).

[shvarz.livejournal.com]

У вас намного более сдержанно.

Мне кажется подобная популяризация сейчас уже вызывает только одно эмоциональное ощущение - "британские учоные открыли", и в результате люди как минимум не верят журналистике, а как максимум считают, что все ученые только и занимаются тем, что обещают вот-вот что-то крутое и полезное сделать, а на самом деле десятилетиями только деньги проедают.

При этом я согласен, что новость должна быть не только аккуратной, но интересной и крутой. Это трудно, да. Но вот, например, здесь можно было сделать упор на крутости использованной системы и побольше рассказать о том, насколько это круто, что она может специфично найти конкретную последовательность в миллиардах нуклеотидов нашего генома. А возможное применение для ВИЧ привести как пример использования подобных технологий.

[asena.livejournal.com]

Я сейчас пытаюсь запустить у нас в бумажном журнале рубрику "инфекции" - с рассказами про разных возбудителей и современные тренды в их лечении. Можно я через несколько месяцев, когда формат устаканится, приду к вам просить о статье про СПИД для нее?

[racoonbear.livejournal.com]

CRISP довольно основательно описан в последней книжке Маркова про эволюцию.
Я недавно её купил, сейчас с интересом читаю.

[lady-alisanda.livejournal.com]

Спасибо за комментарий!

[rusty-spur.livejournal.com]

Элегантно. А отчего тот же HIV не модифицировать для доставки in vivo?

[shvarz.livejournal.com]

Наверно можно, но если он не replication competent, то огромную дозу надо вводить, причем не один раз, чтобы добиться достаточного покрытия.

[shvarz.livejournal.com]

Наверно можно, но если он не replication competent, то огромную дозу надо вводить, причем не один раз, чтобы добиться достаточного покрытия

[vasja-iz-aa.livejournal.com]

я уже писал, жулики они. пользуются тем, что CRISPR популярная нынче слово и пытаются схватить и убежать, пока не началось

[shvarz.livejournal.com]

Не хуже многих :)