Эволюционные масштабы

[shvarz]

Фаги - вирусы бактерий.
В книжке только что прочитал впечатляющий фактоид: По некоторым оценкам общее количество фагов на Земле - порядка 10³¹. Если их всех собрать и выстроить один за другим, то получится цепочка (вчитайтесь!) в 200 миллионов световых лет. Исходя из средней продолжительности жизни фага, можно посчитать, что такое их количество производится за неделю. Каждый новый фаг - это вероятность мутации, рекомбинации - биологический мир исследует пространство возможных белков. Обычно считается, что вирусы появились очень рано в процессе эволюции, так что вполне можно предположить, что это продолжается уже 3 миллиарда лет (15x10¹⁰ недель). Этого достаточно для того, чтобы сгенерировать полностью все варианты пептидов размером в 30 аминокислот (22³⁰).

Comments

[riftsh.livejournal.com]

А между тем, белки из самых разнообразных фагов довольно похожи. На картинке показано MSA gpV гомологов, которые были выбраны так, чтобы максимизировать диверсификацию (т.е., это профаги из самых разных бактерий). При этом, среднаяя парная идентичность последовательностей - 18%, с хорошо консервированными фрагментами и в ядре, и на поверхности белка (кликабельно):
(http://www.pnas.org/content/106/11/4160/F2.large.jpg)

[shvarz.livejournal.com]

Ну конечно фаги не перебирают последовательности совершенно случайным образом, эволюция все же. Но можно и контр-аргументировать тем, что в данный конкретный момент они перебирают варианты в районе данной конкретной области пространства последовательностей :)