Эволюционные масштабы

[shvarz]

Фаги - вирусы бактерий.
В книжке только что прочитал впечатляющий фактоид: По некоторым оценкам общее количество фагов на Земле - порядка 10³¹. Если их всех собрать и выстроить один за другим, то получится цепочка (вчитайтесь!) в 200 миллионов световых лет. Исходя из средней продолжительности жизни фага, можно посчитать, что такое их количество производится за неделю. Каждый новый фаг - это вероятность мутации, рекомбинации - биологический мир исследует пространство возможных белков. Обычно считается, что вирусы появились очень рано в процессе эволюции, так что вполне можно предположить, что это продолжается уже 3 миллиарда лет (15x10¹⁰ недель). Этого достаточно для того, чтобы сгенерировать полностью все варианты пептидов размером в 30 аминокислот (22³⁰).

Comments

[shvarz.livejournal.com]

Нет, не пользовался. У меня есть друзья-знакомые в ncbi, они очень плохо знают биологию, но при этом работают с биологическими базами данных, поэтому не удивлюсь, если там полно косяков.
С другой стороны, NIH содержит этот Ncbi, который не смотря на все свои косяки, является таки очень полезным ресурсом. Он также содержит LANL HIV database, там тоже в основном "такие теоретики" сидят, но есть и вполне грамотные биологи. Польза от них есть.
Говоря "практика" я имел в виду подход типа "взять биолога и научить его информатике" или наоборот. Есть места где это делают и люди оттуда выходят вполне хорошие, хоть и со странным набором знаний и навыков. Я вот лично их и считаю биоинформатиками.

[vasja-iz-aa.livejournal.com]

Ну, мы с Вами почти одно и тоже говорим. Когда надо, тогда и биолог в рабочем порядке осваивает нужное ему из компьютерных технологий и наоборот бывает. Причем выучивают именно то, что им в их конкретной ситуации надо, а не абстрактную биоинформатическую ахинею.

А называться все равно как, я знаю вполне приличных людей вынужденых называть свою работу биоинформатической, современным стечением обстоятельств. Жить то на чтото надо.