Наш внутренний неандерталец
Feb. 8th, 2012 11:52 am![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png)
Как всем уже, наверно, известно - секвинирование ДНК неандертальцев показало, что они с нашими предками какое-то время скрещивались. Антрополог Джон Хокс в своем блоге выложил красивые картинки, показывающие насколько этот факт до сих пор отражается на человеческих популяциях. Он сравнил неандертальский геном с геномами из проекта "1000 геномов" в котором секвинировались геномы людей со всего света.
Результат:

Геномы европейцов и азиатов имеют заметно больше общего с неандертальским геномом, чем геномы африканцев. Этого и следовало ожидать, учитывая, что неандертальцы обитали преимущественно в Европе. Но картинка очень уж красивая.
И вот еще одна тоже очень красивая картинка:

Американские негры являются смесью средне-европейской и западно-африканской популяций (старый пост на эту тему). И это заметно при подобном анализе - они оказываются разбросаны между геномами из Нигерии и из Юты.
Он там еще обсуждает разные интересные результаты, но они куда менее красивые и интерпретировать их труднее.
Результат:

Геномы европейцов и азиатов имеют заметно больше общего с неандертальским геномом, чем геномы африканцев. Этого и следовало ожидать, учитывая, что неандертальцы обитали преимущественно в Европе. Но картинка очень уж красивая.
И вот еще одна тоже очень красивая картинка:

Американские негры являются смесью средне-европейской и западно-африканской популяций (старый пост на эту тему). И это заметно при подобном анализе - они оказываются разбросаны между геномами из Нигерии и из Юты.
Он там еще обсуждает разные интересные результаты, но они куда менее красивые и интерпретировать их труднее.
no subject
Date: 2012-02-08 05:01 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 05:13 pm (UTC)+100 000
визуализация - ВЕЩЬ!
no subject
Date: 2012-02-08 05:30 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 05:34 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 05:32 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 05:37 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 05:44 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 05:47 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 06:23 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 03:00 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 05:43 pm (UTC)То есть доказано, что европейцы смешивались с неaндертальцани, имели общих детей? Без этого как-то непонятно, почему от географической близости возникнет близость генома.
no subject
Date: 2012-02-08 05:45 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 06:47 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 06:52 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 07:00 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 01:00 am (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 04:17 am (UTC)Ну вот Вы, наверное, не затрудняетсь отличать эфиопов от мексиканцев. Но вряд ли сомневаетесь, что они способны давать плодовитое потомство. Если я правильно прикидываю о чем речь.
no subject
Date: 2012-02-09 03:01 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 04:50 pm (UTC)Про выделение я опять не понимаю. Да мало ли кто какие группы, подгруппы и переходные формы выделяет. Среди ныне живущих хомосоапиенсов есть тоже группы, которые все антропологи выделяют. Бушмены, например. Эти бушмены, а те - неандертальцы. Ну и что?
А что такое сильно?
Date: 2012-02-09 07:56 am (UTC)Re: А что такое сильно?
Date: 2012-02-09 03:03 pm (UTC)Re: А что такое сильно?
Date: 2012-02-09 05:03 pm (UTC)систематика, она такая странная достаточно вещь.
no subject
Date: 2012-02-08 07:08 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 09:30 pm (UTC)http://shvarz.livejournal.com/257319.html?thread=4001063
no subject
Date: 2012-02-09 09:35 pm (UTC)Напишите ему письмо. Но странно, что еколи с геномами европейцев и американцев так радикально разделились, если это именно артефакт еколей.
no subject
Date: 2012-02-09 09:50 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 06:30 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-08 11:08 pm (UTC)Сколько всего у человека в геноме этих dv?
Ну у европейца с неандертальцем в среднем 645 К одинаковых dv, а у африканца - 625К. А сколько общих dv у европейца и африканца в среднем?
no subject
Date: 2012-02-09 12:59 am (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 08:06 am (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 03:07 pm (UTC)В предыдущем посте на эту тему есть детали: http://johnhawks.net/weblog/reviews/neandertals/pigmentation/neandertal-introgression-1000-genomes-style-2011.html
no subject
Date: 2012-02-09 11:44 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-10 05:48 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 03:41 am (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 04:25 am (UTC)Я не знал. А когда это выяснилось?
no subject
Date: 2012-02-09 03:10 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 05:26 am (UTC)no subject
Date: 2012-02-09 03:11 pm (UTC)Сейчас поправлю.
no subject
Date: 2012-02-09 08:57 am (UTC)спасибо!
no subject
Date: 2012-02-09 03:12 pm (UTC)no subject
Date: 2012-02-13 08:13 am (UTC)no subject
Date: 2012-12-29 06:15 pm (UTC)