shvarz: (Default)
The power of genetics rests partly in its lack of bias. Often the hypothesis-driven approach to biologic problems creates selffulfilling prophecies, as experiments are constructed to prove the hypothesis rather than to test it. Genetics is also a source of surprise. If one accepts that a particular biologic system has complexity that extends beyond the bounds of the investigator’s imagination,genetics is the tool with which to probe it. Hypotheses are, after all, restricted to what one can imagine. Very commonly, genetics will disclose an essential requirement for a molecule that would never have been “guessed” to be involved in a particular process.

Неплохой обзор TLRs (в открытом доступе)
shvarz: (Default)
В новом PLoS Biology статья про разнообразие того, как нервы подходят к мускулам. Посмотрели на одну конкретную мышцу в разных "мышыцах" и отследили топографию нейронов, которые ее активируют. Нашли довольно большое разнообразие в количестве, длине и разветвлении аксонов. Причем не только между разными мышами, но и между левой и правой половинами мыши. Оно и понятно - сложные организмы строятся не по детальному "чертежу", а согласно неким общим принципам "лишь бы работало". Как получилось во время развития подсоединить нервы к мышцам, так и получилось. Наверняка какая-то система регуляции там есть, но она проверяет лишь функциональность, а не соответствие неким конкретным планам.
Я думаю так очень многие системы в биологии устроены, и внутриклеточные и внеклеточные. Та же имунная система, например, работает достаточно стохастично и регулируется через "консенсус" самых разных сигналов.
Проблема для ученого тут в том, что при такой организации изучаемой системы редукционистский подход становится невозможен (как минимум - очень затруднителен). Каждый конкретный элемент системы сам по себе не влияет на непосредственно на конечный результат. Невозможно его вычленить из остальной системы и оценить его личный вклад в ее функциональность. Из-за стохастичности участвующих процессов каждый редукционистский эксперимент становится неповторимым.
Биология Систем в данном случае может помочь, потому что она основана на суммировании очень большого количества экспериментов, в котором можно проследить корреляцию между "входом" и "выходом". Анализ, правда, для этого требуется достаточно сложный, потому что корреляции могут быть очень слабыми. Например, если сигнал от рецептора Р может идти к эффектору Э через 10 различных параллельных медиаторов М1-М10 (а это довольно частая ситуация в биологических сигнальных системах), то факт вовлечение каждого конкретного медиатора будет очень сложно установить (он будет вовлечен лишь в каждую десятую передачу сигнала). Огрмным плюсом при этом является то, что когда факт существования М1-М10 установлен, и их параметры известны, то редукционистский подход становится опять применим. Только теперь роль "элемента системы" отдается не конкретному белку, а целому комплексу Р/М1-М10/Э и описывается он набором характеристик.

December 2013

S M T W T F S
1234567
891011121314
15161718192021
22232425262728
293031    

Syndicate

RSS Atom

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated May. 25th, 2025 03:42 am
Powered by Dreamwidth Studios