Phylo

[shvarz]

Забавная игрушка
Загружает настоящие ДНК последовательности разных видов животных, представляет нуклеотиды в виде цветных квадратиков и предлагает их выровнять вручную. Задача - сделать это лучше компьютера за отведенное время.



Советую пройти Tutorial и прочитать FAQ, чтобы понять как именно начисляются баллы. Вкратце: По выровняным последовательностям вычисляется общий предок, последовательности сравниваются с ним (не между собой!). За совпадение дают +1 балл, за несовпадение -1 балл, за дырку длиной в один нуклеотид -5 баллов, за каждую следующую дырку рядом -1 балл. Дырки считаются как в центре, так и по краям (я это не сразу понял, но постфактум понятно, почему так сделано). В общем, несколько сложно, но когда разберешься становится довольно интересно. Я частенько выравниваю лучше компьютера.

Утверждается, что результаты всех этих выравниваний потом будут собраны и загружены обратно в базу данных, так что вроде как эти игры принесут некую реальную пользу науке, но это все фигня на мой взгляд. Но поиграть все равно интересно, затягивает.

Comments

[ohohon.livejournal.com]

можно объяснить для тупых и англонеособочитающих, что делать надо?
какой цвет какой нуклеотид обозначает?

[shvarz.livejournal.com]

В том и дело, что это не важно. Знания о ДНК тут совсем не нужны. Требуется двигая мышкой квадратики вправо и влево расставить их так, чтобы было как можно больше вертикальных столбцов одинакового цвета и как можно меньше несовпадений по цвету. При этом за пустые места между квадратиками серьезно штрафуют, то есть их тоже нужно минимизировать. Больше всего штраф за одиночную "дырочку" - 5 баллов, дырочка из двух клеток - 6 баллов, из трех - 7 баллов и так далее.