Phylo

Dec. 1st, 2010 10:34 pm
shvarz: (Default)
[personal profile] shvarz
Забавная игрушка
Загружает настоящие ДНК последовательности разных видов животных, представляет нуклеотиды в виде цветных квадратиков и предлагает их выровнять вручную. Задача - сделать это лучше компьютера за отведенное время.



Советую пройти Tutorial и прочитать FAQ, чтобы понять как именно начисляются баллы. Вкратце: По выровняным последовательностям вычисляется общий предок, последовательности сравниваются с ним (не между собой!). За совпадение дают +1 балл, за несовпадение -1 балл, за дырку длиной в один нуклеотид -5 баллов, за каждую следующую дырку рядом -1 балл. Дырки считаются как в центре, так и по краям (я это не сразу понял, но постфактум понятно, почему так сделано). В общем, несколько сложно, но когда разберешься становится довольно интересно. Я частенько выравниваю лучше компьютера.

Утверждается, что результаты всех этих выравниваний потом будут собраны и загружены обратно в базу данных, так что вроде как эти игры принесут некую реальную пользу науке, но это все фигня на мой взгляд. Но поиграть все равно интересно, затягивает.

Date: 2010-12-02 05:54 am (UTC)
From: [identity profile] galicarnax.livejournal.com
***так что вроде как эти игры принесут некую реальную пользу науке, но это все фигня на мой взгляд***

Однозначно фигня. Эту игрушку прошли со всеми бонусами Нидлман с Вуншем еще в 70 году ;)

Date: 2010-12-02 06:13 am (UTC)
From: [identity profile] vigna.livejournal.com
Я когда-то вообще всё вручную выравнивала :)
Edited Date: 2010-12-02 06:14 am (UTC)

Date: 2010-12-02 03:12 pm (UTC)
From: [identity profile] megazver.livejournal.com
Насчет этой игры не знаю, но, скажем, FoldIt говорят действительно приносит какую-то пользу.

Date: 2010-12-02 03:42 pm (UTC)
From: [identity profile] ohohon.livejournal.com
можно объяснить для тупых и англонеособочитающих, что делать надо?
какой цвет какой нуклеотид обозначает?

Date: 2010-12-03 04:44 am (UTC)
From: [identity profile] selfmade.livejournal.com
не понятно что делать когда score равняется par, но звёздочка не загорается. Обычно это происходит, когда сверху уже лежат несколько посеревших последовательностей. Неужели надо к ним выравнивать? А как понять какой оттенок серого соответствует какому цвету?

В общем, засада настигает меня уже через минуту игры. :(

December 2013

S M T W T F S
1234567
891011121314
15161718192021
22232425262728
293031    

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated May. 28th, 2025 04:46 pm
Powered by Dreamwidth Studios