Phylo

[shvarz]

Забавная игрушка
Загружает настоящие ДНК последовательности разных видов животных, представляет нуклеотиды в виде цветных квадратиков и предлагает их выровнять вручную. Задача - сделать это лучше компьютера за отведенное время.



Советую пройти Tutorial и прочитать FAQ, чтобы понять как именно начисляются баллы. Вкратце: По выровняным последовательностям вычисляется общий предок, последовательности сравниваются с ним (не между собой!). За совпадение дают +1 балл, за несовпадение -1 балл, за дырку длиной в один нуклеотид -5 баллов, за каждую следующую дырку рядом -1 балл. Дырки считаются как в центре, так и по краям (я это не сразу понял, но постфактум понятно, почему так сделано). В общем, несколько сложно, но когда разберешься становится довольно интересно. Я частенько выравниваю лучше компьютера.

Утверждается, что результаты всех этих выравниваний потом будут собраны и загружены обратно в базу данных, так что вроде как эти игры принесут некую реальную пользу науке, но это все фигня на мой взгляд. Но поиграть все равно интересно, затягивает.

Comments

[selfmade.livejournal.com]

не понятно что делать когда score равняется par, но звёздочка не загорается. Обычно это происходит, когда сверху уже лежат несколько посеревших последовательностей. Неужели надо к ним выравнивать? А как понять какой оттенок серого соответствует какому цвету?

В общем, засада настигает меня уже через минуту игры. :(

[shvarz.livejournal.com]

Странно, может баг какой? По идее должна загораться. Посеревшие последовательности на этой стадии не при чем, они позже опять появляются, чтобы можно было выровнять с ними следующие.