shvarz: (Default)
[personal profile] shvarz
Пост обращен, в первую очередь, ко всяким биологам и химикам, так что извините если где-то что-то непонятно.

Я на прошлой неделе был в Институте Эпидемиологии и Микробиологии им. Гамалеи, на территории которого находится компания "Nearmedic". Нам дали тур по компании и рассказали о выпускающемся там препарате Кагоцел, который обладает широким противовирусным эффектом и может использоваться как для лечения, так и для профилактики вирусных инфекций.
На официальном сайте довольно много информации о препарате, включая целую серию научных статей с описанием плацебо-контролированных рандомизированных испытаний препарата на людях.
Препарат является ко-полимером целлюлозы и какого-то растительного полифенола (звучит страшно, но на самом деле довольно безобидно). Химическая его формула приведена на сайте, но для меня это китайская грамота: Натриевая соль сополимера (1→4)- 6- 0- карбоксиметил -β- D-глюкозы, (1→4)- β-D- глюкозы и (21→24)-2,3,14,15,21,24, 29,32-октагидрокси-23-(карбоксиметоксиметил)-7, 10-диметил-4, 13-ди(2-пропил)- 19,22,26,30,31 - пентаоксагептацикло  [23.3.2.216.20.05.28.08.27.09.18.012.17] дотриаконта-1,3,5(28),6,8(27), 9(18),10, 12(17), 13,15-декаена.

Надо сказать что, хотя на сайте есть статьи с испытаниями Кагоцела на людях, там нет статей (и даже ссылок на них) описывающих преклинические исследования и механизмы действия Кагоцела. В презентации, однако, были показаны данные о том, что in vitro препарат подавлял репликацию гриппа, хотя я их по памяти сейчас и не воспроизведу. Помню только, что в качестве одного из положительных (sic!) контролей там использовался арбидол. В ответ на наш вопрос о том, есть ли данные о том, что Кагоцел действительно вызывает индукцию интерферона, нам сказали, что на мышах immunostaining кишечника показал такую индукцию.
Изобретатели объяснили мне механизм действия препарата следующим образом: Кагоцел активирует TLRs на клетках врожденного иммунитета (innate immunity). Эта его активность, видимо, обусловлена повторяющейся структурой полимера, который имитирует поверхности разных патогенов, но точных механизмов я не услышал. Активация этих клеток происходит преймущественно в кишечно-желудочном тракте, потому что полимер довольно велик, не перевариваем, и потому плохо всасываем. Активация всяких DCs, макрофагов и нейтрофилов ведет к выделению интерферонов. Выделяются они, в основном, в кишечнике, но потом диффундируют и имеют системный антивирусный эффект. На мой вопрос о том, не является ли индукция интерферонов вредной для организма (они все-таки много чего делают с иммунной системой и не только), особенно в случае профилактики (то есть для здорового человека), мне ответили, что вызываемые Кагоцелом уровни интерферона довольно низки и потому безопасны.

Что вы обо всем этом думаете? Внушает ли вам доверие такое описание механизма действия Кагоцела? Если даже мы предположим, что он действительно работает именно так, что вы думаете об общем подходе профилактики вирусных инфекций с помощью некой стимуляции уровня интерферонов в организме? Может ли она быть действительно безопасна или при безопасных уровнях интерферон непременно окажется неэффективным? Короче говоря, любые соображения по этой теме приветствуются.

Date: 2010-06-26 05:18 am (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Немного подумал и, кажется, понял, что именно вам нужно. Вы хотите получив некий ПЦР результат, получить также и оценку вероятности того, что этот результат ложноположительный или ложноотрицательный, да?

Эти две вероятности, как я уже говорил, обратно-пропорциональны друг другу. И они могут быть изменены в соответсвии с нуждами эксперимента. Последнее я и имел в виду, когда говорил, что не понимаю, что именно вы хотите, потому что в научной лаборатории никто не делает ПЦР анализ "просто так", это всегда часть большего эксперимента, который и диктует нужды в отношении специфичности. Например, вы уже знаете, что человек инфицирован и вам требуется очень аккуратно установить дату инфекции, анализируя более старые образцы. В такой ситуации вам для вас критично избежать ложноотрицательного результата, а ложноположительный вас не волнует. Почему не волнует? Потому что вы всегда можете заклонировать полученный продукт и отсеквинировать его - по последовательности все ложноположительные результаты будут отброшены. Таким образом вы модифицируете протокол ПЦР так, чтобы как можно больше увеличить чувствительность (зная, что тем самым вы теряете специфичность, но как я уже сказал, в данном случае это не проблема) - увеличиваете количество циклов и понижаете температуру связывания праймера.

Если вопрос в исследовании будет иной, то и логика выбора процедуры будет иной. Например, если вы знаете, что вируса в крови дофига, но вам надо очень аккуратно определить его последовательность, то вы наоборот - уменьшите количество циклов ПЦР, чтобы уменьшить вероятность привносимых ПЦР мутаций.

December 2013

S M T W T F S
1234567
891011121314
15161718192021
22232425262728
293031    

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jun. 8th, 2025 01:31 pm
Powered by Dreamwidth Studios