shvarz: (Default)
Нет, девочку с лейкемией не вылечили "заразив ее ВИЧ". ВИЧ там использовался только как метод доставки нужного гена в Т клетки (благо ВИЧ это умеет очень хорошо). При этом собственно от самого ВИЧ там осталось очень мало. Говорить, что ее вылечили "ВИЧ инфекцией" это все равно что говорить, что "больных вылечили атомной бомбой" если система для доставки атомной бомбы была использована для того, чтобы доставить в город чемодан антибиотиков.

Upd: Вот ведь память дырявая, пока не напомнили я и не сообразил, что писал об этом методе в прошлом году: http://shvarz.livejournal.com/310996.html
shvarz: (Default)
http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa1208394

Большие надежды на вакцину RTS,S не оправдались - эффективность около 30% в большом испытании III стадии. Ранее тестировали ее в небольших испытаниях II стадии и получали около 60%, что тоже не фонтан, но можно было бы лицензировать. Возможно разница в эффективности вызвана тем, что предыдущие испытания проводились в местах, где малярия не очень распространена.
shvarz: (Default)
День СПИДа сегодня, надо бы про что-нибудь написать.
Ну вот, например, народ из Texas Biomedical Research Institute подали заявку на патент своей вакцины. Я бы об этом и не узнал, да журналистка попросила прокоментировать. Пришлось почитать пресс-релиз (в нем ноль информации), и найти постер, который они представляли на последней конференции. Ну, я ей все по полочкам разложил, но в статью ее попали почти исключительно общие фразы. Зато не переврала ничего и цитаты из меня в кавычки поставила. И не попыталась сделать из мухи слона, все довольно реалистично рассказано. Но раз уж я работу проделал, то выложу ее сюда.

Общая идея заключается в том, что с помощью вирусного вектора они хотят модифицировать стволовые клетки эпителия слизистой таким образом, чтобы эпителий постоянно синтезировал некий вирусный белок, таким образом стимулируя иммунный ответ и поддерживая его в течение длительного времени.

Я выделил четыре интересных момента в этом подходе:

  1. Вакцинация слизистых. При сексуальном контакте ВИЧ попадает в организм именно через слизистые и там размножается первые несколько дней. К тому времени как он распространяется системно и вызывает общий иммунный ответ, поезд уже ушел и иммунный ответ остановить инфекцию не может. Иммунный ответ нацеленный именно на слизистые оболочки позволяет поймать вирус на ранней стадии.

  2. Использование клеток эпителия. Клетки эпителия - профессиональные клетки, отвечающие за детекцию и "презентацию" микроорганизмов иммунной системе.

  3. Однако эпителиальные клетки долго не живут, поэтому интересна идея модифицировать стволовые клетки, из которых образуются клетки эпителия. При этом сами стволовые клетки вирусный белок производить не будут, потому что его производство контролируется промотором, включающимся только после того, как стволовые клетки превращаются в клетки эпителия.

  4. Ну и наконец, долговременное производство вирусного белка. На сегодняшний день есть две модели в макаках, которые показывают очень хорошую защиту от инфекции ВИО. Обе из них основаны на том, что вакцинация производится не одноразово, а используется вирус, который устанавливает хроническую инфекцию и производит вирусные белки постоянно. Вроде как это важно, потому что как я уже писал выше, "окно" в котором ВИЧ инфекцию можно остановить - очень коротко, всего два-три дня. При обычной вакцинации повторный иммунный ответ срабатывает быстро, но все-таки недостаточно быстро для полной остановки инфекции. В этих же моделях в слизистой постоянно находятся так называемые "эффекторные Т клетки", которые готовы реагировать на инфекцию мгновенно.


С другой стороны есть и недостатки:

  1. Основной - это то, что на слизистых постоянно живет большое количество разных непатогенных микробов и имунная система умеет их игнорировать. Если мы в отсутствии реальной патогенной инфекции производим ВИЧ белок, то иммунная система может принять его за один из белков этих непатогенных микробов и начать его игнорировать. Таким образом мы вместо иммунитета к ВИЧ выработаем у иммунной системы равнодушие к вирусу. Что не есть good.

  2. C точки зрения регуляторных агенств такой подход тоже вызовет множество вопросов, потому что если вдруг на этот белок у человека случится аллергия или еще какой побочный эффект, то проблемы будут серьезные. Именно потому, что подход основан на том, что белок этот будет производиться постоянно и выключить это никак нельзя.

Вообще же все это очень интересно, но пока крайне гипотетично. У них даже предварительных данных в обезьянах нет, которые бы показывали хоть какую-то защиту от инфекции. Так что рано еще считать цыплят.
shvarz: (Default)
Из интересного за последние два дня:


  • Когда в 2009 году были оглашены результаты испытания ВИЧ вакцины в Тайланде, многие им не поверили, потому что различия между плацебо и вакцинированной группами (30%) были довольно слабыми со статистической точки зрения - буквально на границе стат-значимости и только при использовании незапланированного в изначальном плане анализа. Потом в 2011 году анализ образцов крови показал, что иммунный ответ к району V2 в белке оболочки коррелирует с защитой от вируса. Это указывало на то, что вакцина действительно работает, но корреляция была довольно слабенькая. В этом году Моргейн Ролланд проанализировала геномы вирусов из зараженных людей и нашла, что отличия между вирусами из плацебо и вакцинированной групп тоже находятся в районе V2. Учитывая, что два независимых анализа указывают на один и тот же район в вирусе, теперь не остается почти никаких сомнений в том, что вакцина действительно была эффективна.

  • Группа Беатрис Хан какое-то время уже наблюдает за дикими шимпанзе в Африке. Недавно они показали, что инфекция ВИО в шимпанзе патогенна и ведет к повышенной смертности. С тех пор они сделали аутопсию нескольких трупов и нашли в них типичные признаки СПИДа - пониженное количество CD4 клеток, оппортунистические инфекции. Более того, некоторые популяции изрядно пострадали от вируса - численность за последние 10 лет снизилась на 50-70%, большинство из смертей связано с вирусом. До сих пор ни один из детенышей, рожденных у ВИО-зараженных самок, не выжил. Что с этим делать, не совсем понятно. Беатрис предлагает искать способы для биомедицинского вмешательства.

  • Одной из самых первых протестированных (на обезьянах) вакцин был аттенуированный ВИО с делецией в гене nef. Эта вакцина до сих пор остается самой эффективной из всех опробованных, но как именно она работает никто толком не знает. Группа Эшли Хааса уже довольно давно очень тщательно в этом копается и последние их данные очень интересны. Вакцинированные таким образом макаки в ответ на вирус выделяют цитокины подавляющие воспалительные процессы и иммунный ответ. В результате вирус оказывается лишен активированных клеток-мишеней и не может эффективно размножаться. Почему вакцинация ведет к подобному ответу не совсем понятно, но данные Хааса указывают на то, что у этих макак в слизистых находятся специальные B-клетки, которые постоянно выделяют огромные количества антител и ингибирование иммунного ответа вызывается детекцией вируса покрытого антителами.

  • В тему с пунктом выше: Джейкоб Естес и Брендон Киил заражают макак интравагинальной инокуляцией вируса, потом через несколько дней режут их на мелкие кусочки и таким образом наблюдают самые ранние стадии инфекции. Одна из вещей, которую они таким образом заметили - начальное гнездо инфекции практически всегда находится в районе локального воспаления. В таких местах никаких микро-трещинок не надо, там эпителий тонкий, а CD4 клеток столько, что они буквально вываливаются наружу за пределы эпителия, что и позволяет вирусу начать инфекцию.

  • При грудном вскармливании новорожденный имеет довольно высокий риск инфекции от ВИЧ+ матери (10-15%). Как это происходит не совсем понятно, особенно - какие именно клетки заражаются в первую очередь. ВИЧ предпочитает заражать активированные CD4 клетки памяти, которых у новорожденных по идее должно быть очень мало или не быть вообще (они же еще не встречались с инфекциями, а от матери они не передаются). Маделин Бандерс посмотрела на образцы кишечника полученные при аутопсии новорожденных, умерших от болезней не связанных с ВИЧ. Там она нашла большое количество СD4 клеток, которые не являются клетками памяти, но во многом на них похожи и должны быть хорошими мишенями для вируса. Что это за клетки и откуда они берутся пока непонятно.

shvarz: (Default)
По англоязычным новостным лентам уже прошла новость про эту статью, а сейчас и в русскоязычные просачивается. Естественно, путаницы много, пишут и про "азиатский СПИД" и про "азиатский ВИЧ" и даже про то, что мы все умрем :).

К ВИЧ эта болезнь никакого отношения не имеет вообще (все пациенты ВИЧ-отрицательны). Механизм патологии отличается от СПИДа. При СПИДе происходит потеря CD4 клеток на фоне хронической активации иммунной системы. При этой болезни у человека вырабатываются антитела к собственным иммунным белкам, в частности к антивирусному белку интерферон-гамма, который является сигналом о том, что в организме размножается вирус. Антитела блокируют этот сигнал, и антивирусные механизмы запускаются плохо. Эти люди болеют и бактериальными инфекциями, почему - не совсем понятно, но у некоторых из них находят антитела и к другим сигнальным молекулам, вовлеченным в антибактериальный ответ. В результате внешнее проявление болезни оказывается очень похоже на позднюю стадию СПИДа - в человеке размножаются микробы, которые обычно совершенно безобидны. Но это не СПИД и не ВИЧ.

Почему вдруг случилась вспышка аутоиммунного заболевания - непонятно. На инфекцию не похоже - заболевшие не связаны между собой в эпидемиологические цепочки. На генетическую болезнь тоже не тянет - они не родственники. Болезнь поражает преимущественно людей старше 50. Может что-то в окружающей среде. В принципе, может быть и инфекция, но случившаяся давно.
shvarz: (Default)
Угадайте, что делают на этой фотографии:





Если вы сказали "какашки какие-то", то вы абсолютно правы! Гейтс и ко. устраивают конкурс на изобретение улучшенных туалетов для развивающегося мира. Для честного тестирования и сравнения прототипов они решили создать искусственные фекалии.
детали
shvarz: (Default)
Организованную в мае с моей помощью конференцию по ВИЧ в New York Academy of Sciences полностью выложили в открытый доступ: жать сюда. Там слайды и аудио всех презентаций.

Всем, кто хотя-бы чуть-чуть в теме я особенно рекомендую послушать самый последний файл - дебаты. На их организацию у меня ушло в два раза больше времени и сил, чем на всю остальную конференцию. Результат получился очень классный - вполне серьезную тему обсуждали с шутками и прибаутками.

Если кто вообще не в теме, но имеет интерес услышать мой голос (и как я говорю по-английски), то тоже жмите на последний файл, я там в самом начале пару минут болтаю, немного скомкано, потому что я не подготовился как следует (думал модератор все объяснит, но меня попросили сказать пару слов).
shvarz: (Default)
Интересная история.

На куриных фермах в Австралии появилась новая разновидность герпесвирусов, вызывающих инфекционный ларинготрахеит (ILTV). Курицы регулярно болеют подобными вирусами, со смертностью достигающей 20%. Особенность этой разновидности в том, что она произошла от двух вакцин, которыми фермеры пользовались для предотвращения ITLV.

Аттенуированные вакцины основаны на живых ослабленных вирусах. Для их получения выделяют дикий вирус и дают ему размножаться в необычных для него условиях - например, в животном которое он обычно не заражает, или при более высокой температуре, или даже просто в культуре клеток. Вирус мутирует, приспосабливается к этим условиям, но в результате теряет приспособленность к репликации в своем обычном хозяине. Он все еще живой, но иммунная система легко его побеждает и приобретает иммунитет к дикому вирусу.

Что именно за мутации произошли в ослабленном вирусе никто обычно не смотрит. Дело это очень муторное - мутаций много, какие из них важны разобраться трудно, тем более что некоторые из них важны в комбинации с другими. Важно, что вакцина работает. Недостатком такого подхода, очевидно, является то, что мы не знаем, какие именно мутации важны и насколько трудно вирусу в вакцине будет мутировать обратно в дикий вариант. Такое случается иногда со всеми аттенуированными вакцинами.

В случае с австралийским ITLV, на австралийском рынке появилась новая вакцина из Европы. Поскольку австралийскую и европейскую вакцины получали разными способами, то видимо и ослабляющие мутации у вирусов в этих вакцинах были разные. В какой-то момент эти два вируса попали в одну и ту же курицу, рекомбинировали (обменялись частями своих геномов), и полностью восстановили дикий тип, избавившись от ослабляющих мутаций. Получившийся вирус оказался очень успешен и сейчас вытесняет обычные для Австралии разновидности.

GB virus C

Jul. 12th, 2012 11:15 am
shvarz: (Default)
К сожалению нет времени об этом даже получше почитать, не то что подробней написать, но очень интересная статья вышла.
GB вирус С (да, такое странное название) это флавивирус, который распространяется очень похожим образом с HIV - через кровь и секс. Хотя сначала его подозревали в том, что он вызывает гепатит (и даже назвали его гепатит G), расследование показало, что он совершенно безопасен. Поэтому сейчас на него даже кровь при переливании не тестируют.

В статье показывают, что если ВИЧ-инфицированный заражен и этим вирусом, то у него существенно лучше прогноз болезни и меньше вероятность смерти (adjusted HR = 0.42; 95% CI, 0.24-0.73).

В том, что тут причина, а что следствие, пока до конца не разобрались и механизм совершенно непонятен, но уже народ подумывает о том, чтобы использовать этот вирус для терапии (естественно в комбинации со стандартным лечением). Если GB вирус С действительно является причиной улучшенного прогноза, то отвечающий за это механизм может быть полезен и в разработке превентивной вакцины. Будет забавно, если окажется, что этот совершенно левый вирус несет в себе что-то похожее на консервативные участки ВИЧ и вызывает появление антител, которые эффективно подавляют ВИЧ.

Новость отсюда (английский).
shvarz: (Default)
В Nature статья про синдром Кавасаки. Впервые синдром был описан в 1967 году доктором Кавасаки, который сложил свое описание в папку, названную "Черт знает что такое".
У вполне здорового при рождении ребенка выступила сыпь, поднялась температура, покраснели глаза, ладошки и ноги. Попытки спасти не увенчались успехом. Вскрытие показало множественные аневризмы сосудов и даже сердца.



Сейчас синдром Кавасаки является лидирующей причиной приобретенной болезни сердца у детей до 18 лет. Больше всего случаев фиксируется в Японии, в Штатах - несколько тысяч в год, большинство среди детей младше 5 лет. Природа болезни неизвестна, но подозревается, что ее вызывает какой-то микроб, потому что частота случаев увеличивается сезонно весной и летом и потому что иногда наблюдаются локальные вспышки. В ноябре прошлого года в Nature же была опубликована статья, в которой указывалось, что из большого количества рассмотренных факторов частота синдрома Кавасаки в Японии лучше всего коррелировала с юго-восточным северо-западным ветром.



Это наводит на подозрения о том, что микроб летит откуда-то из центральной Азии. Это само по себе интересно, но проблема с этой теорией еще и в том, что лететь он должен на большой высоте, где условия таковы, что ранее считалось, что в них никакой микроб выжить не может - сухой, очень холодный воздух и большое количество ультрафиолета. То есть это должны быть или какие-то очень мощные споры, или какой-то супер-стабильный вирус.
shvarz: (Default)
Интересный случай - на очень приличной био-медицинской конференции рассказывают про чудотворное действие биодобавки.

Wet Macular Degeneration - это потеря зрения из-за того, что под сетчаткой начинают расти лишние кровеносные сосуды, из которых может выходить излишняя жидкость, что ведет к деформации или даже отслоению сетчатки. Происходит это всегда в центре зрения и постепенно распространяется к краям. В результате вместо нормального зрения получается вот такое:


Наилучшее существующее лечение на сегодняшний день заключается в том, что людям вкалывают под глаз препараты, ингибирующие рост новых кровеносных сосудов (дисклеймер - моя жена работает в компании, продающей одно из подобных лекарств). Уколы нужно ставить регулярно (раз в несколько недель). Зрение может слегка вернуться, но преимущественно лечение ведет лишь к замедлению потери зрения. Помогает не всем.

Так вот, доктор Ричер рассказывает на ARVO о том, что они набрали несколько человек, которым уколы не помогали и стали кормить их биодобавкой Longevinex. Из 17 человек, у 16 зрение улучшилось. Особенно их поразила 88-летняя бабушка, у которой за 4 дня зрение восстановилось очень серьезно - она снова стала различать лица и видеть буквы. Более того, у нее прошли мигрени и снизилось кровяное давление. Группу-плацебо в данном случае не создавали, что конечно, хреново, но не так уж удивительно - это вполне нормальная практика, когда пациенту уже совсем ничего не помогает (особенно часто она встречается в испытаниях антираковых препаратов).

Судя по сайту, Longevinex является натуральным фуфломицином. По крайней мере там полно разной псевдо-научной бредятины, перечислять которую устанет рука. Например, смотрим на вот эту картинку:


Видим, что они добавляют нуклеотиды для того, чтобы помогать репарации ДНК. Что хеляторы у них борются с настоящей причиной старения - как поясняет FAQ, настоящей причиной старения они считают отложение в организме кальция и железа. Естественно, эти плохие кальций и железо "накапливаются" в организме, а биодобавка помогает их "выводить". На главной странице у них написано, что основной активный компонент добавки, резвератол, "положительно активирует сотни и тысячи генов". Естественно, в отличие от всяких там лекарств, резвератол - "натуральный" и даже называется умным словом nutriceutical.

Ну, в общем, желающие могут сами убедиться, что это типичная биодобавка. Означает ли это, что доктор Ричер нам врёт? Кто знает, может эта хрень и правда действует, тем более что я даже данных его не видел. Просто интересный штрих к портрету отношений между классической и альтернативной медициной.
shvarz: (Default)
http://scienceblog.com/53460/death-knell-for-dark-matter-theories/

Говорят искали темную материю в нашей солнечной системе и не нашли, хотя должны были.
shvarz: (Default)
Тот факт, что случаев передачи ВИЧ через оральный секс или через поцелуи практически не зафиксировано, не очень хорошо согласуется с тем, что вскармливаемые грудным молоком дети ВИЧ-положительных матерей заражаются через молоко довольно часто (10-15%). Я всегда думал, что дело преимущественно в дозе (дети высасывают миллилитров по 50 молока за кормежку, по нескольку раз в день), но вот эта статья утверждает, что существует и более биологические объяснение.

В молоке ВИЧ-положительной матери есть три потенциальных источника заражения: вирус сам по себе, зараженные макрофаги, и зараженные лимфоциты. Авторы сравнили эффект всех трех на ротовой эпителий взрослого человека и ребенка.

Вирус пересекает эпителий примерно одинаково у взрослых и у детей и повреждения слизистой для этого не нужны. Клетки эпителия сами захватывают небольшие капельки жидкости снаружи, пропускают их сквозь себя и выпускают с внутренней стороны. Однако вирус, попавший таким образом во взрослого человека, оказывается инактивированным специальными антивирусными белками, а у детей этих белков еще нет.

Зараженные лимфоциты не способны пересекать эпителий ни у взрослых ни у детей и прямиком отправляются в желудок.

А вот зараженные макрофаги ведут себя по-разному во рту у взрослых и у детей. У взрослых они, подобно лимфоцитам, пересечь эпителий не могут и отправляются в плавание по пищеводу. А у детей они способны аккуратно, не нарушая целостности эпителия, пробраться между клетками внутрь. Авторы предполагают, что макрофаги и являются основным источником заражения грудных детей.

(У этой работы есть небольшой нюанс - для нее использовались не биопсии эпителия, взятые у грудных детей, а пост-абортивный материал с 18-24 недель беременности. Вроде как у плода и у новорожденного эпителий внешне не отличается, но биологически они могут иметь разные свойства. Ну и вообще, может биологическое объяснение и не нужно - хорошего сравнения доз вируса в молоке у грудного младенца и в сперме при оральном сексе я не видел.)
shvarz: (Default)
57 лет назад Сиючи Мори начал эксперимент, который продолжается до сих пор: Он начал выращивать популяцию мух-дрозофил в полной темноте. Японец умер, но нашлись последователи. За это время родилось и умерло почти полтры тысячи поколений мух. Мухи не утеряли зрение, как многие пещерные рыбы, но вроде как-то худо-бедно приспособились к темноте. Сейчас пытаются разобраться с тем, что именно с ними произошло - секвинируют их геномы и все такое.

Я не против опытов на животных, наоборот - лучше на них, чем на людях, но чем-то мне эта история не нравится. Несоразмерностью усилий и ожидаемых результатов. Почему-то мне кажется, что ничего особо интересного они там не найдут, а мух таки жалко.

Кстати о пещерных рыбах: Занятный факт (если это факт) - среди глубоководных рыб полно разных флуоресцентных изобретений, а среди пещерных не известно ни одной светящейся рыбы. Почему?

Кстати об опытах на животных: Защитники животных оригинальным способом суют палки в колеса бедным британским ученым - поднимают шум вокруг компаний, которые доставляют лабораторных мышей в Англию. Осталось всего две авиакомпании, которые еще держатся.

CROI

Mar. 13th, 2012 04:37 pm
shvarz: (Default)
Некоторые конференции быстрее других продвинулись в 21 век и уже довольно давно выкладывают все доклады в сети в свободном доступе.
Например - Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections: И слайды, и доклад, и даже видео докладчика. Смотреть.

Что имеет смысл посмотреть тем, кто более-менее в теме сечет, но конкретно ВИЧ не занимается, а хочет получить общее представление:

Для тех, кто несколько более в курсе дел и/или интересуется структурной биологией:
shvarz: (Default)
Интересный пост про то, почему оценки количества смертей от малярии могут отличаться в два раза. У ВОЗ получилось 600 тысяч, а у IHME - 1.2 миллиона.

Вкратце - потому что никто толком не знает, что там в Африке делается. Приходится экстраполировать, а при таких больших цифрах (а в том, что малярии в Африке дофига, никто не сомневается), даже небольшие ошибки накапливаются. Самый показательный пример - данные по всей Нигерии, стране с 150-миллионным населением, пришлось экстраполировать исходя из данных по одной деревне, в которой от малярии предположительно умерло 240 человек. Предположительно - потому что настоящий диагноз никто не ставил, а оценки просто получены по опросам родственников о том, как чувствовал себя человек перед смертью.

Off-top: Кто-нибудь знает хорошие недавние обзорные ревью по гепатиту C? Репликация, лечение, вакцины и т.п.
shvarz: (Default)
Как всем уже, наверно, известно - секвинирование ДНК неандертальцев показало, что они с нашими предками какое-то время скрещивались. Антрополог Джон Хокс в своем блоге выложил красивые картинки, показывающие насколько этот факт до сих пор отражается на человеческих популяциях. Он сравнил неандертальский геном с геномами из проекта "1000 геномов" в котором секвинировались геномы людей со всего света.
Результат:



Геномы европейцов и азиатов имеют заметно больше общего с неандертальским геномом, чем геномы африканцев. Этого и следовало ожидать, учитывая, что неандертальцы обитали преимущественно в Европе. Но картинка очень уж красивая.

И вот еще одна тоже очень красивая картинка:



Американские негры являются смесью средне-европейской и западно-африканской популяций (старый пост на эту тему). И это заметно при подобном анализе - они оказываются разбросаны между геномами из Нигерии и из Юты.

Он там еще обсуждает разные интересные результаты, но они куда менее красивые и интерпретировать их труднее.
shvarz: (Default)
Список 30 лекарств, утвержденных в 2011 году FDA.

Что мне там понравилось, в порядке увеличения крутости:

#5 Ardovax

Что им лечат: ОРЗ в армии
Как применяется: Вакцина в таблетке
Как это работает: Таблетка содержит ослабленные варианты аденовирусов 4 и 7 типа. На них вырабатывается иммунитет, защищающий от диких вирусов.
Почему это круто: Давно, еще в 60-х, было выяснено, что за основную часть ОРЗ в армии отвечают аденовирусы. Вакцину против них делали для армии лет 30, но в 1994 году компания решила перестать ее производить (я не смог найти - почему). Армия затоварилась впрок, но к 1999 году вакцина кончилась. После этого количество аденовирусных инфекций резко увеличилось. Разработка новой вакцины заняла 10 лет и пока она утверждена только для применения в армии. Почему так долго разрабатывали и почему только в армии - тоже не знаю.

#4 Dificid

Что им лечат: Инфекцию Clostridium difficile
Как применяется: Таблетка
Как это работает: Этот препарат - из нового поколения антибиотиков, действующих на узкий спектр бактерий. В данном случае он был разработан специально против бактерии C.dificile.Препарат ингибирует бактериальную РНК-полимеразу, что останавливает все процессы в клетке и убивает ее.
Почему это круто: С. dificile обычно просто болтается в кишечнике и большого вреда не приносит, но иногда после интенсивного приема антибиотиков, которые выкашивают ее конкурентов, она размножается и приводит к диарее. При этом она зловреднючая и обычными антибиотиками ее хрен возьмешь (отсюда и ее название).

#3 Adcetris

Что им лечат: лимфому Ходжкина и еще один редкий вид лимфомы
Как применяется: Внутривенная иньекция
Как это работает: Вещество MMAE останавливает деление клеток, блокируя полимеризацию тубулина. Само по себе применяться не может, потому что слишком токсично - блокирует деление всех клеток без разбору. Поэтому его присоединяют к антителу против белка CD30, который появляется на поверхности активированных лимфоцитов (а раковые лимфоциты обычно активированы). Антитело связывается с белком, клетка всасывает получившийся комплекс, внутри клетки MMAE отсоединяется от антитела и идет в цитоплазм, где блокирует деление. Таким образом препарат действует против всех активированных лимфоцитов, включая раковые.
Почему это круто: Яд, доставляемый внутри организма по нужному адресу – разве не круто?


#2 Victrelis и Incivek

Что им лечат: Гепатит С
Как применяется: Таблетка
Как это работает: Препарат связывается с активным сайтом вирусной протеазы и блокирует ее действие, предотвращая образование новых вирусов.
Почему это круто: Гепатит С стремительно движется по пути ВИЧ – против него разрабатываются специфичные и очень эффективные лекарства. Но в отличие от ВИЧ, этот вирус не имеет долгоживущей латентной стадии, требующей принимать лекарства всю жизнь. Лет через 5-10 он совершенно перестанет быть проблемой в развитых странах, для него будет большой набор лекарств на выбор для проведения терапии на 3-4 недели с полным излечением.

#1 Zelboref и Xalcori

Zelboref

Что им лечат: Меланому (рак кожи)
Как применяется: Тест, потом таблетка
Как это работает: Развитие рака обычно связано с мутациями, которые позволяют клетке неограниченно делиться. Так, определенная мутация (V600E) в гене B-RAF, вовлеченного в передачу сигналов роста, ведет к тому, что этот белок постоянно стимулирует клеточный рост. Данный препарат связывается с B-RAF и полностью ингибирует его, что ведет к тому, что раковая клетка совершает самоубийство.

Xalcori

Что им лечат: Аденокарцинома легких
Как это применяется: Тест, потом таблетка
Как это работает: Белок ALK обычно распознает специальную сигнальную молекулу, что ведет к его полимеризации и активации, которая стимулирует деление клеток. Тут тоже существует специфичная мутация, присутствующая в 3-5% случаев аденокарциномы. При этой мутации ген ALK оказывается слит с геном EML4 и образовавшийся белок начинает спонтанно полимеризоваться и активировать клеточное деление. Препарат ингибирует работу этого белка.

Почему это круто: Оба препарата действуют только на тот рак, в котором есть необходимая мутация (V600E для zelboref, EML4-ALK для Xalcori). Если нужной мутации нет, то препарат неэффективен (а прием zelboref может даже стимулировать рост опухоли). Поэтому для каждого пациента сначала делают тест ДНК опухоли на присутствие мутации, а потом уже решают, давать ли ему соответствующий препарат. Индивидуализированная медицина, невозможная без современной молекулярной биологии!
shvarz: (Default)
...электрических тараканов?



Огайские ученые встроили в таракана электроды, работающие на глюкозе. Таракан бегает как ни в чем не бывало, а ток идет, правда не очень много. Но что вы хотите с таракана? Какие будут идеи насчет того, что можно к этой батарее подключить? Кроме тараканской Матрицы, конечно. Фонарик ему приделать для чтения в темноте? Или сотовый, чтобы с друзьями-тараканами общался?
(via)
shvarz: (Default)
Белок оболочки ВИЧ, как известно, не кристаллизуется. Вот уже двадцать с лишним лет народ бьется, а все без толку. См. пост на эту тему.

Сегодня был на семинаре, где показали практически полную структуру, но полученную не кристаллизацией, а single particle cryo electron microscopy. Принцип такой - делаем миллион (вернее 4 миллиона) электронных фотографий нужного белка, потом три года на компьютере их сортируем и суммируем (для этого, конечно, нужен упорный и талантливый китаец, который не спит, не ест, и отпуск не берет). В результате получаем вполне нативную структуру белка с разрешением в <5A, т.е. близко к кристаллографическому.

Овчинка выделки стоила - структура оказалась довольно неожиданной и при этом многое объясняет о свойствах этого белка. Надеюсь скоро опубликуют (хотя ходят слухи, что Science статью завернула).

December 2013

S M T W T F S
1234567
891011121314
15161718192021
22232425262728
293031    

Syndicate

RSS Atom

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Sep. 24th, 2017 03:34 pm
Powered by Dreamwidth Studios